面包车超员2人的处理及扣分情况，主要依据车辆的性质（营运或非营运）以及超员的比例来确定。以下是对此问题的详细解答：
一、非营运性质面包车超员2人的处理
超员比例计算：
- 若面包车核载7人，实载9人，超员比例约为28.6%。
- 若面包车核载9人，实载11人，超员比例约为22.2%。
处罚措施：
- 记分：根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》，驾驶此类车辆超员未达20%的，记1分；超员20%以上未达50%的，记3分。在您提到的超员2人的情况下，通常属于超员20%以上未达50%的范围，因此会记3分。
- 罚款：根据《道路交通安全法》第九十条，处警告或二十元以上二百元以下罚款。
二、营运性质面包车超员2人的处理
超员比例判断：
- 对于营运性质的面包车，超员2人通常意味着超员比例超过了20%（具体比例需根据车辆核载人数计算，但一般情况下超员2人对于营运车辆而言已属较高比例）。
处罚措施：
- 记分：依据《道路交通安全违法行为记分管理办法》，驾驶营运客车（不含公共汽车）载人超员20%以上的，记6分。
- 罚款：根据《道路交通安全法》第九十二条，处五百元以上二千元以下罚款。
三、其他相关规定及注意事项
货运机动车超载：
- 如果面包车用于货运并超载，同样会面临罚款。超过核定载质量的，处二百元以上五百元以下罚款；超过核定载质量百分之三十或违规载客的，处五百元以上二千元以下罚款。
严重超载或屡教不改：
- 根据法律规定，公安机关交通管理部门可扣留机动车至违法状态消除。对于运输单位车辆，经处罚不改的，对直接负责的主管人员还可处二千元以上五千元以下罚款。
安全提示：
- 面包车超员不仅违反法律法规，更严重影响行车安全，增加交通事故风险。因此，驾驶者应严格遵守交通法规，按照车辆核定人数载客，确保自身和他人的生命财产安全。
四、总结与建议
面包车超员2人的处罚因车辆性质和超员比例而异。非营运车辆通常记3分并罚款，而营运车辆则可能记6分并面临更高的罚款。无论何种情况，超员都是严重的交通违法行为，不仅危及行车安全，还可能引发严重的法律后果。因此，我强烈建议驾驶员务必遵守交通法规，合理规划行程和乘客数量，确保行车安全。