针对您提出的“基本农田种树违反土地法怎么处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、明确结论
在基本农田上种树是违反法律法规的行为，相关部门将依法进行处理，以保护基本农田的合理利用和耕作层的完整性。
二、政策法规依据
《中华人民共和国土地管理法》：该法明确规定，禁止任何单位和个人占用基本农田发展林果业，包括种植树木。这是保护基本农田作为耕地特殊保护部分的重要法律基础。
《基本农田保护条例》：该条例进一步强调，禁止在基本农田保护区内进行破坏基本农田的活动，种树即属于此类违法行为。
三、处理措施
责令限期改正：
- 县级以上人民政府土地行政主管部门或农业农村主管部门将要求违法者在规定期限内移除树木，并恢复基本农田至原状，以确保其重新用于农业耕种。
- 这是最常见的处理方式，旨在及时纠正违法行为，防止基本农田的进一步破坏。
罚款：
- 若违法行为情节严重，相关部门可依照法律法规对违法者处以罚款。
- 罚款金额通常根据违法行为的严重程度、造成的损害及当地法规确定，以起到惩戒和警示作用。
恢复种植条件：
- 违法者需采取相应措施，如平整土地、改良土壤等，使基本农田具备适宜农作物种植的条件。
- 这是确保基本农田能够持续用于农业耕种的重要步骤。
其他行政处罚：
- 在某些情况下，若违法行为特别严重或造成严重后果，相关执法部门可能对违法者采取吊销相关证照、暂停或取消相关资格等其他行政处罚措施。
刑事责任：
- 虽然罕见，但若违法行为构成犯罪（如非法占用农用地罪），违法者需承担相应的刑事责任。
- 这体现了法律对基本农田保护的严格性和严肃性。
影响补贴政策：
- 在一些地区，若农户在基本农田种树，可能会影响其享有的耕地地力保护补贴等相关农业补贴政策。
- 相关部门将停止发放补贴，直至恢复基本农田的正常耕种用途，以激励农户遵守法律法规。
四、实际处理考虑因素
在实际处理过程中，相关部门会综合考虑多种因素，如种树的面积大小、主观故意程度、是否造成严重后果等。对于非主观故意、面积较小且能主动配合整改的情况，处理方式可能相对灵活和宽松。但无论如何，保护基本农田的耕作层和合理利用是首要原则。
五、建议与提醒
- 作为农民或土地使用者，务必遵守相关法律法规，不得擅自改变基本农田的用途。
- 若发现有人在基本农田上种树或其他违法行为，应及时向相关部门举报。
- 政府和社会各界应加强对基本农田保护的宣传教育力度，提高公众对基本农田重要性的认识和重视程度。
综上所述，对于在基本农田上种树的行为，相关部门将依法严格处理，以保护国家粮食安全和农业可持续发展。希望以上解答能够对您有所帮助。