商家在员工违反规定并造成损失时，可以通过以下方式维护自身权益并要求员工赔偿：

1. 明确损失与员工违规行为的因果关系
   首先需证明员工的违规行为与商家遭受的损失之间存在直接因果关系。例如，员工因疏忽导致货物损坏、泄露商业秘密造成客户流失，或违反操作规程引发安全事故等。商家需收集相关证据（如监控录像、操作记录、客户投诉、损失计算依据等），以证明损失的具体金额及与员工行为的关联性。

2. 依据劳动合同或规章制度主张赔偿
   若劳动合同或商家制定的规章制度中明确规定了员工违规行为的赔偿责任（如“因故意或重大过失造成损失的，员工需承担部分或全部赔偿责任”），商家可依据合同条款要求员工赔偿。
   注意：规章制度需经民主程序制定（如职工代表大会讨论）并公示或告知员工，否则可能被认定为无效条款。

3. 通过协商或调解解决
   在证据充分的情况下，商家可先与员工协商赔偿金额及方式（如分期赔偿、从工资中扣除等）。若协商不成，可申请劳动争议调解委员会或第三方调解机构介入，以降低维权成本。

4. 申请劳动仲裁或提起诉讼
   若协商和调解无果，商家可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求员工赔偿损失。仲裁裁决后，若员工不履行，商家可向法院申请强制执行。
   特殊情形：若员工行为涉嫌犯罪（如盗窃、职务侵占等），商家可直接向公安机关报案，追究其刑事责任，同时提起刑事附带民事诉讼要求赔偿。

5. 赔偿范围的限制
   根据《工资支付暂行规定》，商家可从员工工资中扣除赔偿时，每月扣除部分不得超过其当月工资的20%，且扣除后工资不得低于当地最低工资标准。若损失超过员工承受能力，商家需通过其他途径（如协商、诉讼）主张剩余赔偿。

建议商家采取的预防措施：

• 在劳动合同中明确赔偿责任条款；
  
• 完善内部规章制度并确保员工知悉；
  
• 定期培训员工，强化合规意识；
  
• 发生损失时及时固定证据（如书面记录、签字确认等）。
  

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