保障农民工工资条例中的农民工包含多层转包的被雇佣人。

首先，从法律条文的解释角度来看，《保障农民工工资支付条例》的立法目的是为了规范农民工工资支付行为，保障农民工按时足额获得工资。该条例中的“农民工”是指为用人单位提供劳动的农村居民。在多层转包的情况下，虽然农民工与发包人之间可能不存在直接的劳动关系，但他们仍然是为用人单位（或实际施工人）提供劳动的农村居民，因此符合“农民工”的定义。

其次，从实际执行层面来看，多层转包往往导致农民工工资支付链条拉长，容易出现工资拖欠问题。将多层转包的被雇佣人纳入《保障农民工工资支付条例》的保护范围，有助于加强监管，确保农民工的工资权益得到保障。

综上所述，无论是从法律条文的解释角度，还是从实际执行层面来看，保障农民工工资条例中的农民工都应包含多层转包的被雇佣人。如果你在这方面遇到了具体问题或需要进一步的法律咨询，可以直接向我提问，我会尽我所能为你提供帮助。