结论：根据您描述的情况，房产的产权归属主要取决于婚内约定的具体内容以及该约定是否符合法律规定。若婚内约定合法有效且明确房子归妻子所有，则房产证上虽未写双方名字，但产权仍归妻子；若约定存在瑕疵或无效情形，则可能需根据其他因素综合判断产权归属。
详细分析：
婚内约定的法律效力：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，夫妻双方可以就婚姻关系存续期间所得的财产以及婚前财产的归属进行约定。这种约定应当采用书面形式，并且需要双方真实意思表示，不存在欺诈、胁迫等情形，该约定即具有法律效力。
- 在您的情况下，如果婚内约定明确房子归妻子所有，且该约定符合上述法律要求，那么该约定就是有效的，对双方具有约束力。
房产证与产权归属的关系：
- 房产证是证明房屋所有权的重要法律文件，但它并不是确定房屋所有权的唯一依据。在夫妻之间，即使房产证上只写了一方的名字，如果双方有婚内约定且该约定合法有效，那么房屋的所有权仍然可以按照约定来确定。
- 在您的情况下，虽然购房合同上写了双方名字，但房产证上只写了妻子名字，且婚内约定房子归妻子所有。如果这一约定合法有效，那么房产证上的名字与婚内约定并不矛盾，房产的产权仍然归妻子所有。
可能存在的例外情况：
- 如果婚内约定存在瑕疵或无效情形（如一方在签订约定时受到欺诈、胁迫等），那么该约定可能不会被法院认可，此时房产的产权归属可能需要根据其他因素（如购房款的支付情况、房屋的实际使用情况等）来综合判断。
- 另外，如果购房合同和房产证上的信息存在不一致，且双方无法就产权归属达成一致意见，那么可能需要通过法律途径来解决争议。
建议：
- 如果您和妻子之间的婚内约定是合法有效的，并且您希望确保房产的产权归属明确无误，建议您和妻子一起到相关部门办理房产过户手续，将房产证上的名字变更为妻子一人所有（如果尚未变更的话）。
- 如果您对婚内约定的法律效力或房产的产权归属存在疑问或争议，建议您及时咨询专业律师，以便得到更具体、更专业的法律建议。
后续行动：
- 在处理此类问题时，请务必保留好所有相关的法律文件（如购房合同、房产证、婚内约定书等），以便在需要时提供证明。
- 如果您需要进一步的法律帮助或咨询，请随时向我提问，我会根据您的具体情况提供更详细、更专业的法律建议。