关于监委留置超过三个月的原因，这主要涉及到修改后的《中华人民共和国监察法》中关于留置时间再延长和留置时间重新计算制度的相关规定。

首先，我们需要明确的是，一般情况下，留置时间是不超过三个月的。这是为了保障被留置人员的合法权益，防止留置措施的滥用。然而，在特殊情况下，留置时间可以延长，但延长时间也不得超过三个月，因此，留置期限最长不得超过六个月。

那么，什么情况下留置时间会超过三个月呢？这主要有两种情况：

1. 留置时间再延长：

   • 适用条件：可能判处十年有期徒刑以上刑罚，且监察机关依法延长留置时间后仍不能调查终结的案件。
   • 审批权限：地方各级监察机关再延长留置时间需报国家监察委员会批准。
   • 限制次数：虽然法律没有明确规定再延长的具体次数限制，但实际操作中会严格遵循必要性原则，避免不必要的延长。不过，从制度设计上，更侧重于通过严格条件来限制再延长的适用，而非直接规定次数。但值得注意的是，在留置时间重新计算制度中，明确规定了以一次为限。

2. 留置时间重新计算：

   • 适用条件：发现“另有与留置时的罪行不同种的重大职务犯罪或者同种的影响罪名认定、量刑档次的重大职务犯罪”。
   • 适用层级：仅适用于国家监察委员会和省级监察机关办理的案件，市级和县级监察机关调查职务犯罪案件不能重新计算留置时间。
   • 审批权限：省级监察机关重新计算留置时间需报国家监察委员会批准。
   • 限制次数：留置时间重新计算以一次为限，以避免对涉嫌多个罪名的被调查人反复重新计算留置时间。

在实际操作中，监察机关会全面准确理解法律规定，正确适用留置时间再延长和重新计算制度。他们会坚持实事求是、精准有效的原则，科学测算后续留置所需合理时间，既保障办案工作又不超过必要限度。同时，他们也会严格保障被留置人员的合法权益，尊重其人格和民族习俗，保障饮食、休息和安全，提供医疗服务。

因此，如果监委留置时间超过了三个月，很可能是因为案件复杂、涉及罪行重大或者发现了新的重大职务犯罪等情况，需要依法进行留置时间的再延长或重新计算。但无论如何，监察机关都会严格遵循法律规定，确保留置措施的合法、合规和必要。