编制内人员若发现其配偶从事非法经营活动，应立即采取措施制止并主动向单位及纪检监察部门报告，同时积极配合调查；若未及时报告或存在包庇行为，可能面临党纪政务处分，严重者可能被追究刑事责任。以下从不同角度展开分析：

一、编制内人员的法定义务与责任

1. 报告义务
   根据《中国共产党纪律处分条例》《中华人民共和国公职人员政务处分法》等规定，公职人员对配偶、子女及其配偶等亲属的违法违纪行为负有报告义务。若明知配偶从事非法经营活动却隐瞒不报，可能构成“对违法违纪行为知情不报”的违纪行为，面临警告、记过直至开除等处分。

2. 连带责任风险
   若编制内人员利用职务便利为配偶的非法经营活动提供帮助（如泄露信息、干预执法等），可能构成“共同违法”或“滥用职权”，需承担更严重的法律责任，包括刑事责任（如受贿罪、滥用职权罪等）。

二、配偶非法经营活动的法律后果

1. 行政处罚
   若配偶的非法经营活动违反《市场主体登记管理条例》《无证无照经营查处办法》等，可能面临罚款、没收违法所得、责令停业等行政处罚。

2. 刑事责任
   若经营活动涉及非法经营罪、诈骗罪、生产销售伪劣产品罪等犯罪，配偶可能被追究刑事责任。此时，编制内人员若存在共同犯罪或包庇行为，亦可能被牵连。

三、编制内人员的应对措施

1. 立即制止与报告

   • 发现配偶非法经营后，应第一时间劝阻其停止违法行为，并要求其配合调查。
     
   • 向所在单位及纪检监察部门如实报告情况，说明自身是否知情、是否参与或提供便利。

2. 配合调查与整改

   • 主动提供相关证据（如资金往来记录、经营资料等），协助查清事实。
     
   • 若存在管理漏洞（如家庭财产与职务关联），需配合单位进行整改，避免利益冲突。

3. 法律风险隔离

   • 避免使用个人账户参与配偶的经营活动，防止财产混同。
     
   • 若配偶已被立案调查，切勿毁灭、伪造证据或干扰证人作证，否则可能构成妨害作证罪。

四、特殊情形处理

1. 不知情的情况
   若编制内人员确实不知配偶的非法经营活动，且未提供任何帮助，一般不承担法律责任。但需主动说明情况，避免被认定为“疏于管理”。

2. 离婚后的责任
   若配偶的非法经营行为发生在婚姻关系存续期间，编制内人员仍可能因“利益关联”被调查，但离婚本身不免除报告义务。

温馨提示：若您或您的家人涉及此类情况，建议尽快梳理相关证据（如经营合同、资金流水等），并向我详细说明具体情节（如是否参与经营、是否利用职务便利等），以便进一步分析法律风险及应对策略。