结论：在甲乙双方的合同中，一份盖合同章，一份盖公章，通常不会对合同的效力产生实质性影响，但具体还需根据合同内容、双方约定以及相关法律法规来综合判断。

分析说明：

1. 合同章与公章的法律效力：

   • 合同章：是专门用于签订合同的印章，具有签订合同的法律效力。在合同上加盖合同章，通常表示双方对合同内容的认可和接受。
   • 公章：是单位或组织的正式印章，具有最高的法律效力。在合同上加盖公章，同样表示双方对合同内容的确认和承诺。

2. 一份盖合同章，一份盖公章的影响：

   • 合同效力：从法律角度来看，无论是合同章还是公章，只要它们是真实有效的，且加盖在合同上的行为是双方真实意思的表示，那么合同就具有法律效力。因此，一份盖合同章，一份盖公章，通常不会影响合同的效力。
   • 合同解释：如果合同中明确规定了加盖印章的类型或要求，而实际加盖的印章与合同规定不符，那么可能会引发对合同条款的解释争议。但这种情况较为少见，且通常可以通过双方协商或法律途径解决。
   • 交易习惯：在某些行业或地区，可能存在特定的交易习惯或惯例，对合同印章的使用有特定要求。如果双方都遵循这些习惯或惯例，那么即使一份盖合同章，一份盖公章，也可能不会引发问题。

3. 可能的风险与防范：

   • 印章真实性：确保加盖的印章是真实有效的，避免使用伪造或变造的印章。否则，可能导致合同无效或引发法律纠纷。
   • 合同内容明确：在合同中明确约定双方的权利义务、违约责任等条款，以减少因印章使用问题而引发的争议。
   • 双方沟通：在签订合同前，双方应充分沟通并确认对合同条款的理解一致，包括印章的使用要求等。

特殊场景：

• 如果合同中明确规定了必须加盖公章或合同章，而实际加盖的印章与合同规定不符，且双方无法就此达成一致意见，那么可能会影响合同的履行或引发法律纠纷。在这种情况下，建议双方及时协商解决，或寻求法律途径解决争议。

行动建议：

• 如果您在签订或履行合同过程中遇到印章使用问题，建议首先查阅合同条款和相关法律法规，了解双方的权利义务和印章使用的要求。
• 如果问题复杂或无法解决，建议及时咨询专业律师，以便获得更具体的法律建议和帮助。

如有其他法律问题，也可以直接向我咨询，我会结合你的具体情况，给出更全面的法律分析和建议。