在非国家工作人员受贿罪的案件中，刑事判决书本身通常不会直接判决被告人赔偿公司因受贿行为所造成的损失，但会通过追缴或责令退赔的方式处理涉案财物，公司可通过民事诉讼途径另行主张赔偿。以下从不同角度进行详细分析：
一、刑事判决书对赔偿问题的处理原则
在刑事诉讼中，法院的主要任务是确定被告人的刑事责任，即是否构成犯罪以及应受何种刑罚。对于因犯罪行为所造成的物质损失，刑事诉讼法规定了追缴和责令退赔两种处理方式：
追缴：主要针对违法所得的财物，即被告人通过犯罪行为直接获得的财物。法院会判决追缴这些财物，并返还给被害人或上缴国库。
责令退赔：当违法所得的财物无法追缴或原物已不存在时，法院会判决被告人退赔相应的价值。这通常涉及对被害人因犯罪行为所遭受的实际损失进行评估和赔偿。
二、非国家工作人员受贿罪中的赔偿问题
在非国家工作人员受贿罪中，被告人通常是通过收受贿赂来获取不正当利益，这些贿赂往往以现金、财物或其他形式存在。对于这部分违法所得，法院会依法进行追缴。然而，对于公司因受贿行为所遭受的其他损失，如业务机会丧失、声誉损害等，这些通常不属于直接违法所得的范畴，因此刑事判决书不会直接判决被告人赔偿这些损失。
三、公司如何主张赔偿
虽然刑事判决书不会直接判决被告人赔偿公司因受贿行为所造成的全部损失，但公司仍然可以通过以下途径来主张赔偿：
刑事附带民事诉讼：在刑事诉讼过程中，公司可以向法院提起刑事附带民事诉讼，要求被告人赔偿因受贿行为所造成的直接物质损失。但需要注意的是，刑事附带民事诉讼的赔偿范围通常限于直接物质损失，如因受贿行为导致的直接经济损失等，对于间接损失如声誉损害等，可能难以获得支持。
单独提起民事诉讼：公司也可以在刑事诉讼结束后，单独向法院提起民事诉讼，要求被告人赔偿因受贿行为所造成的全部损失，包括直接物质损失和间接损失。在民事诉讼中，法院会根据相关法律法规和证据材料，对赔偿范围和金额进行全面审查和判决。
四、实际操作中的注意事项
证据收集：无论是提起刑事附带民事诉讼还是单独提起民事诉讼，公司都需要充分收集和整理相关证据材料，以证明被告人受贿行为与公司损失之间的因果关系以及损失的具体金额。
法律程序：公司需要了解并遵守相关的法律程序和规定，如诉讼时效、管辖法院等，以确保诉讼的顺利进行和赔偿的有效主张。
专业咨询：由于法律问题具有复杂性和专业性，公司在处理此类问题时最好咨询专业律师的意见和建议，以确保自身权益得到有效维护。
总结来说，虽然刑事判决书不会直接判决非国家工作人员受贿罪的被告人赔偿公司因受贿行为所造成的全部损失，但公司仍然可以通过刑事附带民事诉讼或单独提起民事诉讼等途径来主张赔偿。在处理此类问题时，公司需要充分收集证据、了解法律程序并咨询专业律师的意见和建议。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。