非国家工作人员受贿罪中，公司经济损失的赔偿需结合刑事追缴/退赔、民事赔偿及公司内部追责三方面处理，具体如下：

一、刑事程序中的追缴与退赔（优先适用）

根据《刑法》第64条及司法解释，犯罪分子违法所得的一切财物应予以追缴或责令退赔。具体到非国家工作人员受贿罪：

1. 赃款赃物直接追缴：若受贿所得（如现金、房产、车辆等）仍存在，司法机关可直接查封、扣押、冻结并返还公司；
2. 退赔损失范围：若赃款已被挥霍或转移，犯罪人需以个人财产退赔公司直接经济损失（如因受贿导致的合同差价损失、商业机会丧失等），但不包含间接损失（如公司声誉损害、股价下跌等）。

关键点：刑事退赔具有优先性，公司需在刑事诉讼中通过附带民事诉讼或单独提起民事诉讼主张权利，但实践中多数法院会直接在刑事判决中责令退赔。

二、民事赔偿的补充路径

若刑事退赔不足以覆盖损失，公司可单独提起民事诉讼要求赔偿：

1. 被告范围：除受贿人外，若第三方（如行贿方）与公司存在合同关系且存在过错（如明知受贿仍行贿），可将其列为共同被告；
2. 赔偿范围：包括直接损失（如多支付的货款）及合理间接损失（如为挽回损失支出的律师费、调查费等），但需证明损失与受贿行为存在直接因果关系；
3. 举证责任：公司需提供合同、付款凭证、审计报告等证据，证明受贿行为与经济损失的关联性。

示例：若员工受贿后低价采购劣质原材料，公司可要求其赔偿原材料差价及因质量问题导致的生产停滞损失。

三、公司内部追责与制度完善

1. 追偿权行使：若公司已为员工购买雇主责任险或相关保险，可向保险公司索赔；若员工行为违反公司规章制度，公司可依据《劳动合同法》第39条解除劳动合同并追偿损失；
2. 制度漏洞修复：建议公司完善内部审批流程、财务监管机制（如分权审批、定期审计），并加强员工合规培训，降低未来风险。

实务建议

1. 刑事报案优先：发现受贿行为后，公司应立即向公安机关报案，通过刑事程序固定证据并追缴赃款；
2. 同步民事准备：在刑事立案后，及时委托律师收集民事证据（如合同、转账记录），避免证据灭失；
3. 协商与诉讼结合：若犯罪人愿意主动赔偿，可签订和解协议并申请法院确认；若协商无果，需在诉讼时效内（3年）提起民事诉讼。

提示：具体赔偿金额需结合受贿金额、损失证据、犯罪人偿付能力等因素综合判定，建议公司委托律师制定个性化方案。如有进一步疑问，可直接向我咨询。