生物甲酯燃料的合法性需结合具体情境判断，不能一概而论，以下从不同角度进行分析：

1. 从生产与销售环节来看：

   • 合法性前提：生物甲酯燃料作为一种新型燃料，其生产与销售必须严格遵守国家关于危险化学品、能源产品等相关法律法规。若该燃料被归类为危险化学品，则生产、储存、运输、销售等环节均需取得相应的行政许可，如危险化学品安全生产许可证、经营许可证等。
   • 合规性要求：生产商需确保产品符合国家或行业标准，包括但不限于产品质量标准、安全标准等。同时，销售商也需对产品的合法性进行审查，确保所售产品来源合法、质量合格。

2. 从使用环节来看：

   • 合法使用：若生物甲酯燃料被合法生产并销售，且用户按照产品说明书和相关安全规范正确使用，则其使用行为是合法的。
   • 非法使用风险：若用户未按照规范使用，如私自改装设备、超量储存、在非指定场所使用等，则可能构成违法行为，甚至引发安全事故，需承担相应的法律责任。

3. 从环保与能源政策角度：

   • 政策支持：生物甲酯燃料作为一种可再生能源，若其生产和使用符合国家的环保和能源政策，如减少碳排放、提高能源利用效率等，则可能享受政策优惠和支持。
   • 政策限制：若该燃料的生产或使用过程中存在环境污染、资源浪费等问题，则可能受到政策的限制或禁止。

法律建议：

• 对于生产商和销售商而言，应严格遵守国家法律法规，确保产品的合法性和合规性。在生产、销售前，应充分了解并遵守相关行政许可要求，确保产品符合国家和行业标准。
• 对于用户而言，应选择合法生产并销售的产品，并按照产品说明书和相关安全规范正确使用。在使用过程中，如发现产品存在质量问题或安全隐患，应及时向相关部门报告，并停止使用。
• 若因生物甲酯燃料的生产、销售或使用引发纠纷，建议及时咨询专业律师，了解自身权益和义务，并寻求法律途径解决纠纷。

可能法律后果：

• 若违反相关法律法规，生产商、销售商或用户可能面临行政处罚，如罚款、没收违法所得、吊销许可证等。
• 若因违法行为造成他人损害的，还需承担民事赔偿责任。
• 在严重情况下，如构成犯罪的，还需承担刑事责任。

如有任何关于生物甲酯燃料合法性的具体疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。