结论：一周工作46小时是否合法，需结合用人单位的工时制度、工作安排及劳动者的休息权利保障情况综合判断。在大多数情况下，这超出了法定标准工时，但具体是否违法还需进一步分析。
详细分析
一、标准工时制下的规定
根据《中华人民共和国劳动法》第三十六条的规定，国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。这是标准工时制的基本要求。因此，在标准工时制下，一周工作46小时显然超出了法定上限，属于超时工作。
二、加班与延长工作时间的规定
加班时长限制：
- 根据《劳动法》第四十一条，用人单位因生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可延长工作时间，但一般每日不得超过一小时；特殊情况下需延长工作时间的，每日不得超过三小时，且每月不得超过三十六小时。
- 若一周工作46小时，意味着每天平均工作超过8小时（假设一周工作6天，则每天工作约7.67小时，但若考虑可能的连续工作天数，很可能存在单日工作超过8小时的情况），且很可能超出了每月三十六小时的加班时长限制。
加班工资支付：
- 即使加班在合法范围内，用人单位也必须依法支付相应的加班工资。具体为：延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；休息日安排工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；法定休假日安排工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。
- 若用人单位未支付加班工资，则即使加班时长在合法范围内，也构成违法。
三、特殊工时制的适用
对于某些特殊行业或岗位，如交通、铁路、邮电、水运、航空、渔业等，可能无法完全按照标准工时制来执行。在这些情况下，经劳动行政部门批准，可以实行不定时工作制或综合计算工时工作制等其他工时制度。
- 综合计算工时工作制：以周、月、季、年等为周期综合计算工作时间，但其平均日工作时间和平均周工作时间应与法定标准工作时间基本相同。在综合计算周期内，某一具体日（或周）的实际工作时间可以超过8小时（或44小时），只要综合计算周期内的总实际工作时间不超过总法定标准工作时间即可。若超过，则需依法支付加班工资。
- 不定时工作制：因企业生产特点、工作特殊需要或职责范围的关系，无法按标准工作时间衡量或需要机动作业的职工所采用的一种工时制度。实行不定时工作制的劳动者，不受日延长工作时间标准和月延长工作时间标准的限制，但需确保职工的休息休假权利和生产、工作任务的完成。
若用人单位实行的是特殊工时制，且已获得劳动行政部门的批准，同时确保了劳动者的休息休假权利，那么一周工作46小时可能并不违法。但这种情况较为特殊，且需严格满足相关条件。
四、法律责任与维权途径
如果用人单位违反了工时制度，侵害了劳动者的休息权利，劳动者有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自身的合法权益。劳动监察部门将依法对用人单位的违法行为进行调查处理，确保劳动者的合法权益得到保障。
建议
- 了解工时制度：劳动者应了解自己所在用人单位的工时制度，确保自己的工作时间符合法律规定。
- 保留证据：若发现用人单位存在超时工作、未支付加班工资等违法行为，劳动者应保留相关证据，如工作记录、加班通知、工资条等。
- 及时维权：劳动者在发现自己的权益受到侵害时，应及时向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
若你对一周工作46小时是否合法还有疑问，或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。