做笔录时若存在程序违法情形，可通过以下方式处理，具体需结合违法类型和案件阶段采取针对性措施：

1. 明确程序违法的具体情形

程序违法可能涉及多个环节，需先判断具体违法点，例如：

• 笔录制作主体违法：如非执法人员制作笔录、无执法资格人员参与；
  
• 笔录内容违法：如诱导性提问、威胁取证、未如实记录被询问人陈述；
  
• 权利告知违法：如未告知被询问人“如实陈述义务”“虚假陈述的法律后果”“申请回避权”等法定权利；
  
• 笔录形式违法：如未由被询问人核对签字、捺印，或代签、漏签关键信息；
  
• 取证程序违法：如未出示执法证件、未告知取证目的、未全程录音录像（法定要求时）。
  

法律依据：根据《刑事诉讼法》《治安管理处罚法》《公安机关办理行政案件程序规定》等，笔录制作需严格遵循法定程序，否则可能影响证据效力。

2. 根据案件阶段采取不同救济措施

（1）侦查阶段（刑事案件）

• 提出排除非法证据申请：若笔录因程序违法被认定为“非法证据”，可向侦查机关（如公安局）提出排除申请，要求不得将该笔录作为定案依据。
  
• 申请监督：向检察院提出侦查活动监督申请，检察院有权要求侦查机关纠正违法程序（如补正笔录、重新取证）。
  
• 申诉或控告：若程序违法涉及侵犯人身权利（如刑讯逼供），可向检察院申诉或控告，追究相关人员责任。
  

（2）审查起诉阶段（刑事案件）

• 向检察院提出排除非法证据：在检察院审查起诉时，可提交书面意见，要求排除违法笔录，并附相关证据（如同步录音录像缺失、笔录内容矛盾等）。
  
• 申请听证：对重大案件，可申请检察院召开听证会，就笔录合法性进行质证。
  

（3）审判阶段（刑事/行政案件）

• 申请法庭排除非法证据：在庭审中，可提出“笔录程序违法”的异议，要求法庭启动非法证据排除程序。法院需审查笔录制作是否符合法定程序，若违法则不得采信。
  
• 质证时重点攻击笔录合法性：通过交叉询问（如询问取证人员是否出示证件、是否诱导提问）或提交反证（如现场监控、证人证言），证明笔录内容不真实或程序违法。
  

（4）行政案件（如治安处罚）

• 申请行政复议：若笔录是行政处罚的依据，可向上一级行政机关申请复议，主张笔录程序违法导致处罚决定不成立。
  
• 提起行政诉讼：直接向法院起诉，要求撤销基于违法笔录作出的行政行为，法院将审查笔录合法性并作出裁判。
  

3. 关键注意事项

• 及时固定证据：发现程序违法后，需尽快收集相关证据（如取证时间、地点、人员信息，笔录内容矛盾点等），避免证据灭失。
  
• 区分“瑕疵”与“违法”：若笔录仅存在形式瑕疵（如漏签日期），可要求补正；若涉及核心程序违法（如刑讯逼供），则必须坚决主张排除。
  
• 咨询专业律师：程序违法问题涉及法律技术性较强，建议结合具体案情咨询律师，制定针对性策略（如申请调取同步录音录像、申请证人出庭等）。
  

总结：程序违法的笔录可能被排除或补正，需根据案件阶段（侦查、审查起诉、审判）和违法类型（主体、内容、形式违法）采取不同措施。若您遇到此类问题，可直接向我咨询，我会结合具体案情为您分析应对方案。