农民工认定工伤的依据主要来源于我国现行的《工伤保险条例》以及人力资源社会保障部最新发布的《关于执行〈工伤保险条例〉若干问题的意见(三)》（以下简称《意见(三)》）。以下是对农民工认定工伤依据的详细解释：

一、基本法律依据

《工伤保险条例》是我国工伤保险制度的基本法律，它明确了工伤认定的基本原则、条件和程序。对于农民工而言，只要他们与用人单位建立了劳动关系，并参加了工伤保险，就有权在发生工伤时享受相应的工伤保险待遇。

二、工伤认定的核心要素

根据《工伤保险条例》和《意见(三)》的规定，工伤认定的核心要素包括“工作时间、工作场所、工作原因”。具体来说：

1. 工作时间：指的是劳动者在用人单位规定的工作时间内进行工作的时间段。对于农民工而言，这通常包括他们按照用人单位的安排进行工作的时间。

2. 工作场所：指的是劳动者进行工作的地点或区域。对于农民工而言，这可能包括工地、工厂、车间等他们实际进行工作的场所。

3. 工作原因：指的是劳动者受伤或患病与工作之间的直接因果关系。这是工伤认定的关键要素，需要证明劳动者的受伤或患病是由于工作原因导致的。

三、特殊情形的工伤认定

针对农民工这一特殊群体，以及近年来工伤认定中出现的“模糊地带”，《意见(三)》作出了明确的判断依据：

1. 违法分包转包和个人挂靠情形：

   • 《意见(三)》明确要求社会保险行政部门应受理此类工伤认定申请，从制度层面破除了维权壁垒。这意味着，即使农民工与用人单位之间的劳动关系不明确，只要存在违法分包转包或个人挂靠的情形，且农民工是在工作过程中受伤的，他们仍然有权申请工伤认定。

2. 居家办公情形：

   • 对于按照单位安排居家办公的农民工，如果他们有充分证据证明在居家工作期间确因工作原因受到事故伤害的，不应因在家工作而影响认定工伤。但需要注意的是，利用现代通信方式进行简单工作沟通，具有临时性和偶发性的，不视为工作原因。

3. 上下班途中情形：

   • 《工伤保险条例》第十四条(六)规定，在上下班途中，受到非本人主要责任的交通事故或者城市轨道交通、客运轮渡、火车事故伤害的，应当认定为工伤。《意见(三)》进一步细化了上下班途中的具体情形，包括职工以上下班为目的、在合理时间内往返于工作单位和居住地之间的合理路线等。

四、工伤认定的程序和要求

农民工在申请工伤认定时，需要遵循一定的程序和要求：

1. 及时报告：农民工在发生工伤后，应及时向用人单位报告，并尽可能保留相关证据。

2. 提交申请：用人单位或农民工本人（或其近亲属）应在规定时间内向社会保险行政部门提交工伤认定申请，并附上相关证据材料。

3. 审核认定：社会保险行政部门将对申请进行审核，并根据调查结果作出工伤认定决定。

五、注意事项

1. 保留证据：农民工在申请工伤认定时，应尽可能保留与工伤相关的证据材料，如医疗记录、工作记录、证人证言等。

2. 了解政策：农民工应了解工伤保险政策的相关规定，以便在发生工伤时能够及时维护自己的合法权益。

3. 寻求帮助：如果农民工在申请工伤认定过程中遇到困难或问题，可以寻求当地劳动保障部门或法律援助机构的帮助。

综上所述，农民工认定工伤的依据主要包括《工伤保险条例》和《意见(三)》的相关规定。在申请工伤认定时，农民工应了解并遵循相关程序和要求，并尽可能保留与工伤相关的证据材料。