关于您提到的“抽烟被学校叫家长签字按手印录像，停课5天，只签了一份留在学校，是否会被入档案”的问题，这主要取决于学校的具体规章制度以及对此类事件的处理流程。

首先，从您提供的《烟台市蓬莱区职业中等专业学校学生管理制度》来看，学校对于学生在校园内抽烟的行为有明确的处罚规定。一般来说，首次发现会给予警告处分，并要求写出书面保证；第二次违犯则给予记过处分；第三次违犯，学校会通知家长将学生领回家反省一周，并给予留校察看处分。不过，该制度中并未直接说明抽烟行为是否会直接记入学生档案，但通常记过或留校察看等较严重的处分是有可能被记入档案的，作为学生不良行为的一种记录。

其次，关于您提到的“只签了一份留在学校”的情况，这可能是学校要求家长和学生共同签署的一份保证书或处理决定书，以确认双方对处理结果的知晓和接受。这份文件留在学校，很可能是作为学校处理该事件的一个依据或记录。至于是否会被入档案，这还是要看学校的具体规定和操作流程。有些学校可能会将此类文件作为档案的一部分进行保存，而有些学校则可能只是将其作为处理当前事件的一个临时记录。

最后，我建议您直接咨询学校的相关部门或老师，了解学校对于此类事件的具体处理流程和规定。他们可以给出最准确、最权威的答复，包括是否会被入档案、入档案的具体条件以及后续可能的影响等。

总的来说，虽然无法直接确定您的行为是否会被记入档案，但根据学校的规章制度和常规操作流程来看，较严重的处分是有可能被记入档案的。因此，我建议您认真对待学校的处理决定，积极改正错误，避免再次违犯校规校纪。同时，也可以主动与学校沟通，了解具体情况和后续处理方式，以便更好地应对和解决问题。