结论：二级轻伤案件到检察院撤诉（即不起诉）后，通常不会留下案底，但具体需根据不起诉的类型及案件实际情况来判断。以下是对此问题的详细分析：
一、案底的定义
案底，一般指某人过去犯法或犯罪行为的记录，又称犯罪人员犯罪记录制度。在我国法律中，通常指有过刑事犯罪前科的档案记录，这些记录存放在公安部门与相关国家机关。
二、不起诉的法律后果及类型
根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，不起诉主要分为以下几种类型，每种类型对案底的影响也不同：
法定不起诉：
- 法律依据：根据《刑事诉讼法》第十六条，若案件存在情节显著轻微、危害不大等六种情形之一，检察院应作出法定不起诉决定。
- 法律后果：由于最终没有认定犯罪嫌疑人构成犯罪，因此不会留下案底。
酌定不起诉：
- 法律依据：依据《刑事诉讼法》第一百七十七条第二款，对于犯罪情节轻微且不需要判处刑罚或免除刑罚的，检察院可以作出酌定不起诉决定。
- 法律后果：酌定不起诉意味着犯罪嫌疑人的行为已构成犯罪，但因情节轻微等原因未被起诉。实务中对此是否算有案底存在争议，但主流观点认为，虽然会留下违法犯罪记录，但这并不等同于正式的犯罪记录，且不影响当事人获得无犯罪记录证明。
证据不足不起诉：
- 法律依据：根据《刑事诉讼法》第一百七十五条第四款，若二次补充侦查后证据仍不足，检察院应作出证据不足不起诉的决定。
- 法律后果：由于没有足够证据证明犯罪嫌疑人构成犯罪，根据疑罪从无的原则，这种情况不会留下案底。
三、二级轻伤案件到检察院撤诉的具体影响
在二级轻伤案件中，如果检察院决定撤诉（即不起诉），那么：
- 若属于法定不起诉或证据不足不起诉：由于最终没有认定犯罪嫌疑人构成犯罪，因此不会留下案底。
- 若属于酌定不起诉：虽然犯罪嫌疑人的行为已构成犯罪，但因情节轻微等原因未被起诉。实务中通常认为不会留下正式的犯罪记录，但可能留下违法犯罪记录（具体需根据地方实务操作判断）。不过，这并不影响当事人获得无犯罪记录证明，且这些记录通常不会对日常生活产生直接影响。
四、特殊情况与注意事项
- 行政处罚的可能性：虽然检察院作出了不起诉决定，但公安机关仍可能对行为人进行行政处罚，如罚款、拘留等。这些行政处罚记录虽然不属于犯罪记录，但在某些情况下也可能对个人产生一定影响。
- 民事赔偿责任：即使检察院不起诉，受害人仍然有权提起民事诉讼要求赔偿。行为人可能需要承担民事赔偿责任，包括医疗费用、误工费、护理费、交通费、精神损害抚慰金等。
- 对未来生活的影响：虽然没有案底，但相关事件可能在一些特定场合（如政审、入职背景调查等）被提及或考虑。不过，由于酌定不起诉通常不被视为正式的犯罪记录，因此这种影响相对较小。
五、建议与行动
- 了解具体不起诉类型：如果案件涉及不起诉决定，建议向检察院或律师了解具体的不起诉类型及法律后果。
- 保留相关法律文书：保留不起诉决定书等法律文书，以备将来需要证明无犯罪记录时使用。
- 咨询专业律师：如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。作为专业律师，我将根据您的具体情况提供针对性的法律分析和应对策略。
总结：二级轻伤案件到检察院撤诉后，通常不会留下案底，但具体需根据不起诉的类型及案件实际情况来判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。