当国有农用地使用权到期时，其处理方式主要依据土地的性质、使用目的以及相关法律法规的规定。以下是一个详细且深入的解答，帮助您理解并处理这一问题：
一、了解土地使用权类型与期限
首先，需要明确您的农用地是通过划拨还是出让方式获得的。划拨土地使用权一般无明确的使用期限限制，但通常受到严格的转让、出租和抵押限制。而出让土地使用权则有明确的最高使用年限，如农业用地可能根据具体用途设定不同的使用期限。
二、确认续期资格与条件
非住宅用地（包括农用地中的非住宅部分）：
- 如果您的农用地使用权是通过出让方式获得的，并且即将到期，您需要在期限届满前向相关部门提出续期申请。
- 续期申请需要满足一定的条件，如土地使用符合规划、未造成土地资源浪费或环境污染等。
- 经批准后，您可能需要重新签订土地使用权出让合同，并支付相应的土地使用权出让金。
住宅用地（若农用地中包含住宅部分）：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，住宅建设用地使用权期限届满时自动续期。
- 这意味着您无需专门提出续期申请，房屋所有权人可以继续合法使用该土地及其上的住宅。
- 关于续期费用的缴纳或减免，将依照法律、行政法规的规定办理，目前具体费用标准和支付方式尚未有明确详细法律规定，但立法意图是保障居民居住权益，尽量降低负担。
三、准备申请材料（针对非住宅用地续期）
如果您需要申请续期，应准备以下材料：
- 土地使用权续期申请书；
- 原《国有土地使用证》及权属证明文件；
- 身份证明材料（个人为身份证，企业为营业执照）；
- 土地开发利用情况报告（展示您对土地的有效利用情况）；
- 规划部门意见（如果涉及土地用途变更，需要提供）；
- 环境评估报告（对于可能对环境产生影响的农用地项目）。
四、提交申请流程
- 向自然资源主管部门提出申请：携带完整材料至当地不动产登记中心或国土资源局窗口办理续期手续。
- 审核与公示：主管部门会核查材料的真实性，必要时组织现场勘查，并通过官网公示续期意向。
- 缴纳费用：如果续期申请获得批准，您需要按新合同约定标准缴纳土地使用权出让金及其他相关税费。
- 领取新证书：完成缴费后，您将领取更新后的《不动产权证书》，明确新的使用期限。
五、特殊情形处理
- 土地使用权收回：如果您未申请续期或申请未获批准，土地使用权将由国家依法收回。在此情况下，国家应对土地上的建筑物、构筑物及其附属设施进行合理补偿，以保障您的合法权益。
- 政策差异：不同地区的具体政策可能有所差异，因此您应根据当地实际情况办理相关手续，并及时了解当地政策法规的变化。
六、建议与注意事项
- 提前规划：建议您在土地使用权届满前6个月启动续期申请流程，以避免超期影响您的权益。
- 专业咨询：如遇复杂情况或不确定如何处理，建议您及时咨询当地土地管理部门或专业法律人士，以获取准确指导和帮助。
综上所述，国有农用地使用权到期的处理方式需根据土地性质、使用目的以及相关法律法规和政策规定来确定。在处理过程中，您应注重保护自己的合法权益，并遵循相关法律法规和政策规定。