在开标前一天下午有供应商提出质疑，开标当日是否可以回复，这主要取决于质疑的具体内容、相关法律法规以及招标文件的规定，但通常情况下，开标当日可以且应当对质疑进行初步回应或说明。以下从几个方面进行详细分析：
法律法规的要求：
- 根据《中华人民共和国招标投标法》及相关实施条例，供应商对招标文件有异议的，应当在投标截止时间前提出。招标人应当自收到异议之日起3日内作出答复；作出答复前，应当暂停招标投标活动。虽然这一条款主要针对的是对招标文件的异议，但供应商在开标前提出的质疑，如果涉及招标文件的实质性内容或影响投标的有效性，招标人也应给予及时回应。
- 在实际操作中，如果质疑内容简单明了，且不影响开标的正常进行，招标人可以在开标当日对质疑进行口头或书面的初步回应，以维护开标的公正性和透明度。
招标文件的规定：
- 招标文件通常会明确规定供应商提出质疑的时间、方式以及招标人回应质疑的期限和方式。如果招标文件中有明确规定开标当日可以对质疑进行回应，那么招标人应当遵循这一规定。
- 如果招标文件没有明确规定，但考虑到开标的时效性和公正性，招标人通常会在开标当日对质疑进行初步回应，以避免因质疑处理不当而导致的开标延误或争议。
实际操作中的考虑：
- 在实际操作中，如果供应商在开标前一天下午提出质疑，且质疑内容较为复杂或需要进一步调查核实，招标人可能无法在开标当日给出最终答复。但即便如此，招标人也应至少在开标当日对质疑进行初步回应，说明已收到质疑并正在处理中，以维护开标的正常秩序。
- 如果质疑内容简单且不影响开标，招标人可以在开标现场直接回应质疑，消除供应商的疑虑，确保开标的顺利进行。
法律建议：
- 作为招标人，在收到供应商的质疑后，应尽快对质疑进行审查和分析，确定质疑的性质和影响范围。
- 如果质疑内容简单且不影响开标，可以在开标当日进行初步回应；如果质疑内容复杂或需要进一步调查核实，应告知供应商将在规定时间内给出最终答复，并暂停相关招标投标活动直至答复作出。
- 在处理质疑时，应确保回应的公正性、透明度和及时性，以维护招标投标的公平竞争环境。
可能后果：
- 如果招标人未能及时回应供应商的质疑，可能导致供应商对招标过程的公正性产生质疑，进而引发投诉或争议。
- 在极端情况下，如果质疑处理不当或未及时回应，可能导致整个招标投标活动被宣告无效或重新进行。
因此，建议招标人在收到供应商的质疑后，根据质疑的具体内容和相关法律法规以及招标文件的规定，及时、公正、透明地作出回应。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。