一个承包单位并非只能开一个保证金户，具体开设数量需根据实际情况和相关规定来确定。以下从不同角度进行分析：

1. 法律法规层面：目前并没有明确的法律法规直接规定一个承包单位只能开设一个保证金账户。保证金账户的开设主要是为了保障工程项目的顺利进行，确保承包单位能够按照合同约定履行义务。只要符合相关法律法规的要求，如账户开设的合规性、资金使用的合法性等，承包单位是可以根据需要开设多个保证金账户的。
2. 合同约定层面：在具体的工程项目合同中，可能会对保证金账户的开设数量、资金管理等方面有特别约定。如果合同中有明确规定只能开设一个保证金账户，那么承包单位就需要遵守这一约定。但如果合同中没有相关限制，或者允许根据项目需要开设多个账户，那么承包单位就可以根据实际情况进行开设。
3. 实际操作层面：在实际操作中，承包单位可能会因为不同的工程项目、不同的合作方或者不同的资金管理需求而开设多个保证金账户。例如，一个承包单位可能同时承接了多个工程项目，每个项目都需要开设独立的保证金账户来管理项目资金；或者，承包单位可能与不同的银行合作，根据银行的政策和服务优势选择开设多个账户。