结论：以工程款形式抵押的车位被别人查封后，一般情况下不能直接进行备案，但具体能否备案还需根据查封的性质、抵押的效力以及相关法律规定综合判断。以下从不同角度进行分析：
一、查封对抵押车位备案的影响
查封的法律效力：
- 查封是法院依法对财产采取的一种强制措施，旨在限制财产的处分权，确保将来判决的执行。一旦车位被查封，其处分权（包括转让、抵押、备案等）将受到限制。
备案的法律要求：
- 备案通常指的是将相关事项记录在官方登记簿上，以产生公示公信的效力。对于车位而言，备案可能涉及产权登记、抵押登记等。
- 在车位被查封的情况下，由于处分权受到限制，因此直接进行备案可能会受到法律阻碍。
二、抵押与查封的关系
抵押的效力：
- 如果车位已经以工程款形式合法抵押给债权人，那么债权人享有对该车位的抵押权。抵押权是一种优先受偿权，即在债务人不履行债务时，债权人有权就抵押物优先受偿。
查封与抵押的冲突：
- 当车位同时存在抵押和查封时，需要判断查封是否影响了抵押权的行使。如果查封是基于与抵押无关的债务或纠纷，且查封行为未违反法律规定，那么查封可能会暂时限制抵押权的行使，包括备案等处分行为。
- 但如果查封行为本身存在违法或不当之处，或者抵押权设立在先且合法有效，那么抵押权人可能有权通过法律途径挑战查封的效力，从而恢复对抵押物的处分权。
三、具体法律建议
核实查封原因和性质：
- 首先，需要核实车位被查封的具体原因和性质。如果查封是基于与抵押无关的债务或纠纷，且查封行为合法有效，那么可能需要等待查封解除后再进行备案。
评估抵押权的效力：
- 其次，需要评估抵押权的设立是否合法有效。如果抵押权设立在先且符合法律规定，那么抵押权人可能有权通过法律途径维护自己的权益。
咨询专业律师：
- 由于涉及复杂的法律关系和程序问题，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议。律师可以根据具体情况分析查封与抵押的效力、冲突及解决方案，并协助制定合适的法律策略。
考虑法律途径：
- 如果认为查封行为违法或不当，或者抵押权受到不当侵害，可以考虑通过法律途径（如提出执行异议、申请复议或提起诉讼等）来维护自己的权益。
后续行动建议：如果您面临此类问题，建议尽快收集相关证据材料（如抵押合同、查封裁定书等），并咨询专业律师以获取更具体的法律建议。同时，注意关注查封的进展和抵押权的行使情况，以便及时采取应对措施。