在刑事案件中，如果司法鉴定单位程序违法导致错判，当事人是有权申请赔偿金的。以下从多个角度为你详细分析：

法律依据

根据《中华人民共和国国家赔偿法》的相关规定，行使侦查、检察、审判职权的机关以及看守所、监狱管理机关及其工作人员在行使职权时，如果侵犯公民、法人和其他组织的合法权益造成损害的，受害人有依照本法取得国家赔偿的权利。其中，就包括了对错误判决的赔偿情形。当司法鉴定单位程序违法，进而影响到案件的公正判决，导致当事人被错误定罪或量刑过重时，这便构成了对当事人合法权益的侵犯，当事人有权依据国家赔偿法申请赔偿。

申请赔偿的条件

1. 程序违法事实：必须存在司法鉴定单位程序违法的事实。这通常需要通过法律程序进行确认，比如通过再审程序撤销原判决，并认定原鉴定程序违法。
2. 错判结果：由于程序违法，导致了错判的结果。错判可能表现为无罪判有罪、轻罪重判等。
3. 因果关系：程序违法与错判结果之间必须存在因果关系。即错判是由于司法鉴定单位的程序违法直接导致的。

申请赔偿的程序

1. 确认错判：首先，需要通过法律程序（如再审）确认原判决是错误的，并且是由于司法鉴定单位程序违法导致的。
2. 提出赔偿申请：在确认错判后，当事人可以向作出错误判决的机关（通常是法院）提出国家赔偿申请。申请时需要提交相关证据材料，证明程序违法、错判结果以及两者之间的因果关系。
3. 赔偿决定：作出错误判决的机关在收到赔偿申请后，会进行审查，并作出是否赔偿的决定。如果决定赔偿，会与当事人协商赔偿金额和方式；如果决定不予赔偿，当事人可以依法向上一级机关申请复议或向法院提起诉讼。

赔偿范围与标准

根据国家赔偿法的规定，赔偿范围通常包括人身自由赔偿金、生命健康赔偿金以及财产损失赔偿金等。具体赔偿标准会根据错判的性质、后果以及当事人的实际情况等因素进行综合确定。例如，对于人身自由赔偿金，通常会按照国家上年度职工日平均工资乘以被限制人身自由的天数来计算。

实际操作建议

1. 收集证据：在申请赔偿前，当事人应尽可能收集相关证据材料，证明司法鉴定单位程序违法、错判结果以及两者之间的因果关系。
2. 咨询专业律师：由于国家赔偿申请涉及复杂的法律程序和专业知识，建议当事人在申请前咨询专业律师的意见，以确保申请的顺利进行和成功。
3. 关注时效：国家赔偿申请有一定的时效限制，当事人应在知道或应当知道权益受到侵害之日起一定期限内提出申请，以免错过时机。

最后需要强调的是，虽然当事人有权申请赔偿金，但赔偿的获得并不是必然的。它取决于多种因素的综合考量，包括程序违法的严重程度、错判的后果以及当事人的实际情况等。因此，在申请赔偿前，当事人应充分了解相关法律法规和程序要求，并做好充分的准备和规划。如果你在此过程中有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。