保险公司要求免除后期肺部疾病责任是否合理，需分情况讨论，关键在于保险合同条款的约定以及理赔时是否履行了充分告知义务。具体分析如下：

1. 若保险合同中明确约定“新冠住院理赔后，免除后续肺部疾病责任”
   这种情况下，保险公司的要求可能具有合同依据。但需进一步审查该条款是否属于“免责条款”：

   • 根据《保险法》第十七条，保险公司需对免责条款履行明确说明义务（如加粗提示、口头解释等），否则条款可能无效。
     
   • 若保险公司无法证明已尽到说明义务，您可主张该条款不生效，要求保险公司继续承担后续肺部疾病责任。

2. 若保险合同中无相关约定，或约定模糊
   保险公司的要求缺乏合同依据，属于单方变更合同内容的行为，您有权拒绝。此时可主张：

   • 保险公司应按合同约定履行赔付义务，不得擅自免除责任；
     
   • 若保险公司坚持拒赔，可通过协商、投诉（如向银保监会）或诉讼途径维权。

3. 若肺部疾病与新冠住院存在直接因果关系
   即使合同有免责条款，也可能因“显失公平”被挑战：

   • 例如，肺部疾病是新冠治疗的必然并发症（如肺纤维化），此时免责条款可能因排除被保险人主要权利而被认定无效；
     
   • 需结合医学证据证明疾病与新冠治疗的关联性，必要时申请司法鉴定。

行动建议：

1. 立即查阅保险合同，重点核对“责任免除”“特别约定”等条款；
   
2. 整理理赔时的所有材料（如病历、理赔通知书、沟通记录），确认保险公司是否履行告知义务；
   
3. 若协商无果，可向当地银保监会投诉或直接起诉，主张继续履行赔付责任。
   

如有进一步细节（如合同条款内容、肺部疾病类型等），可随时补充说明，我会为您具体分析。