夫妻婚内协议经过修改并互按手印签字后，只要修改内容合法且双方意思表示真实，该协议仍然具有法定效力。以下从几个关键角度为你详细分析：

1. 协议修改的合法性

• 内容合法性：婚内协议的修改内容必须符合法律法规的强制性规定，不得违反公序良俗。例如，不能通过协议约定逃避法定抚养义务、赡养义务，或限制一方的基本人身权利（如离婚自由权）。若修改内容涉及非法目的（如转移财产逃避债务），则该部分条款无效，但不影响其他合法条款的效力。
• 形式合法性：修改后的协议需满足书面形式要求，且双方签字并按手印。根据《民法典》相关规定，书面形式是婚内财产协议的有效形式要件，签字并按手印可视为双方对修改内容的确认，增强协议的证明力。

2. 双方意思表示的真实性

• 自愿性：修改协议必须基于双方自愿，不得存在欺诈、胁迫、乘人之危等情形。若一方在修改协议时受到不正当影响（如威胁离婚、限制人身自由等），导致其违背真实意愿签字，则该协议可能因“可撤销”而被法院认定无效。
• 完全民事行为能力：双方需具备完全民事行为能力（即年满18周岁且精神正常）。若一方为限制民事行为能力人（如未成年人、精神病人），则其签字行为需经法定代理人同意或追认，否则协议无效。

3. 协议修改后的效力认定

• 整体效力：若修改内容合法且双方意思表示真实，修改后的协议自签字并按手印之日起生效，对双方具有法律约束力。原协议中未修改的部分继续有效，修改部分以新协议为准。
• 部分无效情形：若修改内容中存在违法或违背公序良俗的条款（如约定“出轨方净身出户”可能因显失公平被部分调整），法院可能仅认定该部分无效，其余合法条款仍有效。

4. 实务建议

• 明确修改范围：在修改协议时，建议用醒目字体（如加粗、下划线）标注修改内容，并注明“本协议为对原协议的修改，原协议与本协议不一致之处，以本协议为准”，避免歧义。
• 保留证据：修改协议时，建议双方全程录音录像，或邀请无利害关系的第三方见证，以证明修改过程自愿、真实。
• 公证增强效力：若涉及大额财产分割或复杂条款，可考虑对修改后的协议进行公证。公证文书具有更强的证明力，可减少后续纠纷。

5. 可能的风险点

• 手印的证明力：虽然按手印可增强协议的证明力，但若一方否认手印真实性，可能需通过司法鉴定确认。因此，签字仍是主要认定依据，手印为辅助。
• 未修改条款的效力：若原协议中存在未修改但显失公平的条款（如约定“一方放弃所有财产”），修改时未一并调整，可能因违反公平原则被法院调整。

总结：婚内协议的修改需满足“内容合法+意思表示真实”两大核心要件，签字并按手印可视为双方确认。为确保协议效力，建议明确修改范围、保留证据，必要时进行公证。若对协议效力存疑，可直接向我咨询，我会结合具体条款为你详细分析。