男方可以写遗嘱将个人财产部分留给孩子，但需注意房屋贷款及产权归属问题对遗嘱效力的影响。具体分析如下：

1. 遗嘱的合法性
   根据《民法典》第1133条，自然人有权通过遗嘱将个人财产指定由法定继承人（如子女）继承。因此，若房屋产权登记在男方名下或属于夫妻共同财产中男方个人份额部分，男方可通过遗嘱将该部分财产留给孩子。

2. 房屋贷款与产权归属的关联性

   • 若房屋为男方个人财产（如婚前全款购买或婚后明确约定归男方所有）：
     男方有权通过遗嘱处分全部产权，但需注意：若贷款未还清，银行可能要求继承人继续履行还款义务或提前清偿贷款，否则可能影响产权过户。孩子继承房产后，需承担剩余贷款的还款责任。
     
   • 若房屋为夫妻共同财产（如婚后共同购买）：
     男方仅能处分自己享有的份额（通常为50%）。遗嘱中处分女方份额的部分无效，女方仍有权参与分配其份额。

3. 遗嘱形式与生效条件
   遗嘱需符合法定形式（如自书遗嘱需亲笔书写、签名并注明日期；代书遗嘱需两名无利害关系人见证等）。若遗嘱形式不合法，可能导致无效。

4. 实务建议

   • 明确产权归属：建议先通过协议或诉讼确认房屋产权比例，避免遗嘱因产权争议失效。
     
   • 清偿贷款：若经济条件允许，可提前还清贷款，简化继承流程。
     
   • 公证遗嘱：为增强遗嘱效力，可办理公证遗嘱，减少后续纠纷。
     
   • 告知继承人：建议将遗嘱内容告知配偶及子女，避免家庭矛盾。

总结：男方有权通过遗嘱将个人财产留给孩子，但需确保遗嘱内容合法、产权清晰，并考虑贷款清偿问题。如有复杂情况（如产权争议、贷款金额较大等），建议进一步咨询以制定个性化方案。