针对您提出的“违法可以不配合调查吗以及如何处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、不配合调查取证是否违法
不配合调查取证是否违法，这并非一个绝对的问题，而是需要根据具体情况来分析。在大多数情况下，配合司法机关或行政机关依法进行的调查取证是每个公民的义务。如果您不配合，可能会构成违法，并需要承担相应的法律责任。然而，也存在一些特殊情况，即当调查取证主体不合法或程序不合法时，您有权拒绝配合，且这种拒绝并不构成违法。
二、法律依据与公民义务
司法机关的调查取证：
- 在刑事诉讼中，犯罪嫌疑人、被告人有义务如实回答侦查人员的提问，但与本案无关的问题有权拒绝回答。若采取暴力、威胁等手段阻止证人作证或指使他人作伪证，可能构成妨害作证罪。
- 在民事诉讼和行政诉讼中，法院有权进行调查取证，当事人和其他诉讼参与人有义务配合。若不配合，法院可采取训诫、罚款、拘留等强制措施。
行政机关的调查取证：
- 行政机关在履行管理职责时，有权进行调查取证。例如，工商行政管理部门查处假冒伪劣商品，环保部门调查环境污染事件等。
- 根据《中华人民共和国行政处罚法》，当事人或有关人员应如实回答询问并协助调查，不得拒绝或阻挠。否则，可能面临警告、罚款等行政处罚；构成违反治安管理行为的，由公安机关依法处罚。
三、不配合调查取证的法律后果
- 治安管理处罚：不配合调查取证可能面临警告、罚款或拘留等处罚。
- 刑事责任：若以暴力、威胁方法阻碍国家机关工作人员依法执行职务，情节严重的，可能构成妨害公务罪，面临刑事处罚。
- 其他后果：在特定领域，如证券市场，拒绝、阻碍监管机构的监督检查，还可能被记入失信“黑名单”，影响个人或企业的信誉。
四、特殊情况下不违法的情形
- 调查取证主体不合法：若调查取证主体没有合法授权或超越法定权限，您有权拒绝配合，且这种拒绝并不构成违法。
- 调查取证程序不合法：即使调查取证主体合法，但若未遵循法定程序（如未出示合法证件、未说明调查目的和依据），您也有权拒绝配合，且这种拒绝同样不构成违法。
五、建议与总结
配合司法机关和行政机关的调查取证是每个公民的义务，这有助于维护社会治安和公共利益。然而，在面临调查取证要求时，您也应关注调查主体的合法性和程序的合规性。如果您认为调查存在不合法之处，有权拒绝配合并寻求法律援助。在大多数情况下，我建议您积极配合调查取证工作，以避免不必要的法律风险。如果您对调查过程或结果有任何疑问或不满，可以通过合法途径提出异议或申诉。