关于您提出的“员工手册更新不签字是否有效”的问题，这涉及到用人单位制定或修改员工手册的法定程序以及员工对此的权益。

首先，我们需要明确的是，根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，必须经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，并与工会或者职工代表平等协商确定。这一规定确保了员工在涉及自身切身利益的事项上有参与讨论和协商的权利。

针对您的情况，如果员工手册进行了更新，但这一更新过程并未遵循上述的民主程序，即未经职工代表大会或全体职工讨论，也未与工会或职工代表平等协商，那么这样的更新在程序上就是存在瑕疵的。未经法定程序更新的员工手册，不能直接作为用人单位管理员工的合法依据。

进一步地，如果员工拒绝在更新后的员工手册上签字，这并不意味着员工手册就无效或不能对员工产生约束力。但是，如果用人单位试图依据这样未经法定程序更新且员工未签字的员工手册来对员工进行处罚或解除劳动合同，那么这样的行为在法律上是不被支持的。因为，如前所述，未经法定程序更新的员工手册不能作为解除劳动关系的合法依据。

以实际案例为例，有物流公司未经工会及职工代表大会讨论便下发了修改员工手册的通知，员工拒绝签字后，公司试图以此为由开除员工。但最终，劳动争议仲裁委员会支持了员工的仲裁请求，确认公司解除劳动合同违法。同样，也有食品公司单方调整员工工作时间并要求员工签字确认，员工拒绝后被公司辞退，最终仲裁委也支持了员工关于赔偿金的仲裁请求。

综上所述，员工手册的更新必须遵循法定程序，未经法定程序更新的员工手册不能直接作为管理员工的合法依据。员工拒绝在未经法定程序更新的员工手册上签字，并不影响其法律效力上的瑕疵，用人单位不能以此为由对员工进行处罚或解除劳动合同。如果用人单位违反这一规定，员工有权向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，维护自己的合法权益。