关于工伤期间全勤奖是否可以扣除的问题，这并非一个简单的“是”或“否”的答案，而是需要综合考虑法律法规、公司规章制度以及实际情况来做出判断。
首先，从法律法规的角度来看：
根据《工伤保险条例》第三十三条的规定，职工因工作遭受事故伤害或患职业病需要暂停工作接受医疗的，在停工留薪期内，其原工资福利待遇应保持不变，并由所在单位按月支付。这里的“原工资福利待遇”是包括职工正常出勤时的全部工资性收入和福利待遇的，全勤奖作为与出勤挂钩的一种奖励，理应被视为原工资福利待遇的一部分。因此，从法律精神出发，工伤期间职工因非主观原因缺勤，其全勤奖原则上是不应被扣除的。
其次，我们需要考虑公司规章制度的影响：
尽管法律规定了工伤期间的待遇原则，但实际操作中还需考虑公司的具体规章制度。如果公司规章制度中明确规定了全勤奖的发放条件，并且这些条件严格依据实际出勤天数，且该制度已经过民主程序制定、内容合法并已向员工公示，那么公司在工伤期间可能会依据此规定扣除全勤奖。但这样的扣除可能会引发争议，因为工伤停工是法律赋予职工的权利，严格扣除可能与《工伤保险条例》的立法精神相悖。
在实际操作中，我建议您采取以下步骤：
查阅公司规定：仔细查阅所在公司的相关规章制度或劳动合同，了解全勤奖的具体发放条件及工伤期间的待遇规定。
与公司协商：如果对公司规定有疑问或认为不合理，建议与所在部门或人力资源部门进行协商，寻求双方都能接受的解决方案。
寻求法律帮助：如果协商无果，您可以依法通过劳动仲裁或诉讼等法律途径来维护自己的合法权益。在这个过程中，专业律师的咨询和协助将起到重要作用。
最后，我想强调的是：
工伤是职工在工作中遭受的意外伤害，职工在此期间的权益应得到充分保障。公司作为用人单位，应严格遵守法律法规的规定，确保工伤职工的合法权益不受侵害。同时，职工也应了解自己的权益和义务，积极维护自己的合法权益。
综上所述，工伤期间全勤奖的扣除与否并非一概而论，而是需要综合考虑法律法规、公司规章制度及实际情况。在处理此类问题时，建议您保持理性、公正的态度，与公司进行积极沟通协商，共同寻求合理合法的解决方案。