个体户知识经营公司代发工资是否合法，需分情况讨论：

1. 若个体户与知识经营公司之间存在合法有效的委托代发工资协议：

   • 在这种情况下，个体户委托知识经营公司代发工资是合法的。根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关法律法规，工资支付是用人单位的法定义务，但用人单位可以通过合法的方式委托第三方进行工资支付，只要这种委托关系是基于双方的真实意思表示，且不违反法律法规的强制性规定。
   • 关键点：确保委托协议合法有效，明确双方的权利义务，包括工资支付的金额、时间、方式等，以避免潜在的纠纷。

2. 若个体户与知识经营公司之间不存在合法有效的委托代发工资协议，或知识经营公司未经个体户同意擅自代发工资：

   • 在这种情况下，知识经营公司的行为可能构成违法。因为工资支付是用人单位的专属义务，未经用人单位同意，第三方不得擅自代发工资。如果知识经营公司未经授权代发工资，可能会引发一系列法律问题，如工资支付纠纷、税务问题等。
   • 关键点：个体户应确保对工资支付有完全的控制权，未经其同意，任何第三方不得擅自代发工资。如果发现知识经营公司擅自代发工资，个体户应及时采取措施，如要求停止代发、追回已支付的工资等。

3. 从税务和合规角度考虑：

   • 无论个体户是否委托知识经营公司代发工资，都需要确保工资支付符合税务和合规要求。这包括正确计算和扣缴个人所得税、按时申报和缴纳社会保险费等。
   • 关键点：个体户应了解并遵守相关税务和合规规定，确保工资支付的合法性和合规性。如果委托知识经营公司代发工资，应明确双方在税务和合规方面的责任和义务。

法律建议：

• 如果个体户考虑委托知识经营公司代发工资，应签订合法有效的委托协议，明确双方的权利义务和责任划分。
• 个体户应定期对工资支付情况进行监督和检查，确保工资支付的准确性和合规性。
• 如果发现知识经营公司存在违法或违规行为，个体户应及时采取措施，如要求停止违法行为、追回损失等，并考虑向相关部门投诉或寻求法律援助。

可能法律后果：

• 如果个体户与知识经营公司之间的委托代发工资协议无效或存在违法违规行为，可能会面临工资支付纠纷、税务处罚等法律后果。
• 如果知识经营公司未经个体户同意擅自代发工资，可能会构成侵权或违法行为，需要承担相应的法律责任。

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