在重大伪造合同多起诈骗款案中，即使被告人认罪认罚，司法机关仍可能会继续调查其账户。以下是对此问题的详细分析：
一、认罪认罚的法律意义与程序影响
认罪认罚是刑事诉讼中的一项重要制度，它允许犯罪嫌疑人、被告人自愿如实供述自己的罪行，对指控的犯罪事实没有异议，并接受检察机关提出的量刑建议，签署认罪认罚具结书。这一制度旨在提高诉讼效率，节约司法资源，并鼓励犯罪嫌疑人、被告人悔罪自新。然而，认罪认罚并不等同于案件的终结或司法机关不再进行进一步的调查。
二、账户调查的必要性
核实犯罪事实与金额：在金融诈骗案件中，账户资金流动是证明犯罪事实和犯罪金额的关键证据。即使被告人认罪认罚，司法机关仍需通过调查账户来核实犯罪的具体金额、资金流向以及是否存在其他未被指控的犯罪行为。
追缴赃款赃物：根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔。因此，调查账户也是为了追缴赃款赃物，保护被害人的合法权益。
确保量刑的准确性：账户调查结果可能影响量刑的轻重。例如，如果调查发现被告人存在隐匿、转移财产等行为，可能会对其量刑产生不利影响。
三、认罪认罚后账户调查的实际情况
调查可能继续进行：认罪认罚后，司法机关仍可能根据案件需要，继续调查被告人的账户。这包括查询银行流水、冻结账户、扣押相关财物等措施。
调查范围与深度可能因案而异：不同案件的调查范围和深度可能因案件性质、犯罪情节、被告人认罪态度等因素而有所不同。在一些重大、复杂的金融诈骗案件中，账户调查可能更加深入和细致。
四、被告人的权利与义务
配合调查的义务：作为被告人，有义务配合司法机关的调查工作，包括提供账户信息、协助查询银行流水等。
申请法律援助的权利：如果被告人在调查过程中遇到法律问题或需要法律帮助，可以申请法律援助或委托律师代理。
五、建议与注意事项
如实供述与配合调查：被告人应如实供述自己的罪行，并积极配合司法机关的调查工作。这有助于争取从宽处理，并减少不必要的法律风险。
关注账户安全：在案件处理过程中，被告人应关注自己的账户安全，避免账户被非法冻结或扣押。如果发现账户异常，应及时与司法机关或律师联系。
咨询专业律师：如果被告人对账户调查或认罪认罚等法律问题存在疑问或担忧，可以直接向我咨询。我将根据案件具体情况，提供专业的法律意见和帮助。
综上所述，即使被告人认罪认罚，司法机关仍可能会继续调查其账户。这是为了核实犯罪事实与金额、追缴赃款赃物以及确保量刑的准确性。因此，被告人应如实供述与配合调查，并关注账户安全。如有任何法律问题或需要法律帮助，请直接向我咨询。