当员工提交工伤认定申请，且公司收到工伤认定举证通知书时，公司需要按照以下步骤来撰写和准备举证材料，以确保有效维护自身权益，并促进工伤认定工作的公正、准确进行：
一、审阅通知书，明确要求
首先，公司需仔细阅读工伤认定举证通知书的全部内容，特别是关于举证期限、提交方式、所需证据的具体类型等关键信息。明确并牢记通知书中的截止日期，避免逾期提交导致的法律后果。
二、全面收集并整理证据
根据通知书的要求，公司需要全面收集与工伤认定相关的证据材料，包括但不限于以下几类：
劳动关系证明：
- 劳动合同：证明公司与员工之间存在劳动关系，以及具体的工作岗位、工作时间等信息。
- 考勤记录：证明员工的出勤情况，确认事故发生时是否处于正常工作时间。
事故现场证据：
- 照片、视频资料：直观反映事故发生的环境和状况。
- 目击证人证言：获取目击证人的详细描述，包括事故发生的时间、地点、经过等关键信息，并要求证人签字确认。
公司管理证据：
- 安全生产规章制度：证明公司已履行管理职责，制定了相关的安全生产规定。
- 安全培训记录：证明公司对员工进行了必要的安全教育，员工了解并应遵守相关安全规定。
医疗诊断证明：
- 医疗诊断书、病历及治疗记录：了解员工的受伤情况和治疗过程，判断伤情与事故的关联性。
其他相关证据：
- 根据具体情况，可能需要收集设备故障报告、安全检查报告等其他类型的证据。
三、撰写举证说明
在收集完证据后，公司需要撰写一份详细的举证说明，内容应包括：
- 公司观点：明确表达公司对员工工伤认定申请的观点，是支持还是反驳，并说明理由。
- 证据列举：将收集到的证据材料进行整理，详细列举每份证据的来源、证明内容和目的。例如，“劳动合同，证明员工与公司存在劳动关系；考勤记录，证明事故发生时员工处于正常工作时间；医疗诊断书，证明员工的伤情与事故有关联”等。
- 逻辑论证：结合相关法律法规和证据，对公司的观点进行逻辑严密的论证。说明为什么认为员工的受伤情况符合或不符合工伤认定的标准。
四、按时提交证据
根据通知书的要求，公司需要通过指定方式（如现场提交、邮寄等）在规定期限内提交举证说明和证据材料。务必确保所有材料在截止日期前送达指定地点，并保留好提交凭证，以备后续查询和证明之用。
五、积极配合调查与后续处理
- 响应询问：对社会保险行政部门的询问积极响应，如实提供信息。
- 协助调查：配合进行现场勘查、调查取证等工作，为工伤认定提供必要的协助。
- 关注结果：密切关注工伤认定的进展，及时获取认定结果。如对认定结果有异议，应在规定期限内按照法定程序提出复议或诉讼。
- 承担责任：若员工被认定为工伤，公司应依法承担相应责任，如支付工伤待遇等。同时，总结分析工伤事故，采取措施预防类似事故再次发生。
通过以上步骤，公司可以全面、准确地准备并提交工伤认定举证材料，有效维护自身权益，并促进工伤认定工作的公正、准确进行。