结论：通过学法减分后，已缴纳的罚款不能退回。

1. 学法减分的性质与目的
   学法减分是公安机关交通管理部门为鼓励驾驶人主动学习交通法规、减少交通违法行为而推出的一项便民措施。其核心逻辑是：驾驶人通过学习考试或参与交通安全公益活动，可减免部分因交通违法产生的记分，但不涉及罚款的减免或退还。罚款与记分是两种独立的处罚措施，学法减分仅针对记分部分，不影响罚款的缴纳义务。

2. 罚款的法律依据与不可逆性
   根据《道路交通安全法》及相关法规，罚款是针对交通违法行为的行政处罚，具有强制性和终局性。一旦罚款决定生效（如驾驶人已签字确认或行政复议/诉讼程序终结），罚款即成为国家财政收入的一部分，不存在因后续行为（如学法减分）而退还的法律依据。即使记分被减免，罚款的缴纳事实已成立，无法撤销或返还。

3. 学法减分与罚款的关联性分析
   学法减分的适用条件是驾驶人已因交通违法被记分，且罚款已缴纳或处罚决定已生效。其设计初衷是通过教育手段降低再违法风险，而非为驾驶人提供“经济补偿”。因此，学法减分与罚款退还无直接关联，驾驶人不得以“已学法减分”为由要求退还罚款。

4. 特殊情形排除
   若驾驶人认为原处罚决定存在错误（如证据不足、程序违法），可通过行政复议或行政诉讼途径申请撤销处罚决定。若复议或诉讼成功，原罚款决定被撤销，则已缴纳的罚款可依法退还。但此情形与学法减分无关，而是基于对原处罚合法性的审查。

建议：若对交通违法处罚有异议，可依法申请行政复议或提起行政诉讼；若仅希望减少记分，可通过学法减分程序实现，但无需期待罚款退还。如有进一步疑问，可直接向我咨询交通违法处理相关法律问题。