村集体的承包合同不按公章而按手印，合同效力需分情况判断，具体分析如下：

1. 若合同主体为自然人，手印可替代公章
   根据《民法典》第四百九十条，自然人签订合同可采用书面、口头或其他形式。若承包方为村民个人（自然人），手印与签字具有同等法律效力，均能体现当事人真实意思表示。此时即使未加盖公章，只要手印真实且合同内容合法，合同仍有效。例如：村民张三承包村集体鱼塘，在合同上按手印并由村干部签字见证，该合同具备法律效力。

2. 若合同主体为村集体经济组织，需以公章为准
   村集体作为特殊法人主体（《民法典》第九十六条），其对外签署合同需通过法定代表人签字并加盖公章来确认效力。若仅按手印而未加盖公章，可能因缺乏形式要件被认定为效力瑕疵：

   • 内部程序瑕疵：若手印为村主任或负责人所按，且合同内容经村民会议或村民代表会议决议通过，实践中可能被认定为有效，但存在被认定为“表见代理”的风险；
     
   • 外部效力风险：若合同相对方为第三方（如企业），未加盖公章可能导致第三方质疑合同真实性，村集体可能以“未授权”为由主张合同无效，此时需结合手印主体身份、合同履行情况等综合判断。

3. 关键补充：手印的真实性与合同内容合法性
   无论是否加盖公章，合同效力还需满足：

   • 手印需为当事人真实意思表示（非胁迫、欺诈）；
     
   • 合同内容不违反法律强制性规定（如土地用途、承包期限等）；
     
   • 若涉及重大资产处置，需符合《村民委员会组织法》规定的民主议定程序（如经村民会议三分之二以上成员同意）。

建议：若您是村集体或承包方，为避免纠纷，签订合同时应同时要求法定代表人签字并加盖公章；若已按手印未盖章，可补充签署《确认书》或通过村民会议决议追认效力。具体操作可进一步向我咨询，我会结合合同文本和当地政策为您详细分析。