电子债权凭证在符合一定条件时可以用来支付工程款，但具体能否使用以及使用方式需结合以下角度分析：

1. 法律性质与合同约定
   电子债权凭证本质是记载债权债务关系的电子化凭证（如电子商业承兑汇票、供应链金融平台签发的凭证等）。若工程合同中明确约定可用电子债权凭证支付工程款，或双方事后达成补充协议，则具有合法性。
   法律依据：根据《民法典》第469条，书面形式包括数据电文（如电子凭证），只要能“有形地表现所载内容”即可。

2. 凭证的可流通性与真实性

   • 可流通性：若凭证具备可转让、可兑付属性（如经银行或第三方平台背书），且接收方同意接受，则可作为支付工具。
     
   • 真实性验证：需确保凭证来源合法、未被篡改（如通过区块链技术存证），避免因伪造或重复使用引发纠纷。

3. 行业惯例与监管要求

   • 建筑行业惯例：部分大型工程中，业主或总包方会通过供应链金融平台签发电子债权凭证，用于向分包方支付款项，此类操作需符合平台规则及行业规范。
     
   • 监管限制：若凭证涉及票据行为（如电子商业汇票），需遵守《票据法》及央行相关规定，例如出票人需具备真实交易背景。

4. 风险防范建议

   • 明确条款：在合同中约定电子凭证的签发、兑付、违约责任等细节，避免模糊表述。
     
   • 验收流程：接收方应核实凭证真实性（如通过平台查询、联系出票人确认），并保留证据。
     
   • 争议解决：若发生纠纷，可依据合同约定申请仲裁或诉讼，同时注意电子证据的固定（如公证、时间戳）。

总结：电子债权凭证支付工程款在法律上可行，但需以合同约定为基础，并确保凭证合法、真实、可流通。建议双方在操作前充分沟通，必要时咨询律师设计合规方案。如有具体案例或凭证类型，可进一步向我咨询细节。