核心结论：客户点的一桌菜中有一个菜存在问题时，赔偿方式需根据具体情况确定，主要包括协商赔偿、依据《消费者权益保护法》赔偿以及依据《食品安全法》赔偿三种情况。以下为详细说明：

1. 协商赔偿

   • 协商基础：当发现菜品存在问题时，首先建议商家与客户进行友好协商。这是解决此类纠纷最直接、高效的方式，双方可以就赔偿金额、方式等达成一致意见。
   • 协商内容：协商时，客户可以提出合理的赔偿要求，如免除该有问题的菜品费用、给予一定的折扣、提供其他补偿（如赠送菜品、优惠券等）。商家则应根据实际情况，如问题的严重程度、对客户造成的影响等，给予合理的回应。
   • 协商结果：如果双方能够达成一致意见，应签订书面协议或保留相关证据（如聊天记录、录音等），以便后续执行。

2. 依据《消费者权益保护法》赔偿

   • 法律依据：根据《消费者权益保护法》的相关规定，消费者在购买、使用商品或接受服务时，享有合法权益受保护的权利。如果商家提供的菜品存在质量问题，如变质、有异物等，侵犯了消费者的合法权益，消费者有权要求商家进行赔偿。
   • 赔偿方式：客户可以要求商家退还该有问题的菜品费用，并可以根据情况要求商家给予一定的赔偿，如赔偿因食用问题菜品导致的医疗费用、误工费用等。如果商家的行为构成欺诈，客户还可以要求商家按照购买商品价款的三倍进行赔偿，增加赔偿的金额不足五百元的，为五百元。
   • 维权途径：如果商家拒绝赔偿或协商无果，客户可以向当地消费者协会投诉，或者向市场监管部门举报，也可以通过法律途径提起诉讼，维护自己的合法权益。

3. 依据《食品安全法》赔偿

   • 法律依据：如果问题菜品涉及食品安全问题，如不符合食品安全标准、含有有害物质等，客户还可以依据《食品安全法》的相关规定要求商家进行赔偿。
   • 赔偿方式：根据《食品安全法》的规定，消费者除要求赔偿损失外，还可以向生产者或者经营者要求支付价款十倍或者损失三倍的赔偿金；增加赔偿的金额不足一千元的，为一千元。但是，食品的标签、说明书存在不影响食品安全且不会对消费者造成误导的瑕疵的除外。
   • 维权要点：在依据《食品安全法》维权时，客户需要提供充分的证据证明菜品存在食品安全问题，如检测报告、医疗证明等。同时，客户也需要注意保留好相关证据，如购物小票、菜品照片等，以便后续维权。