不让员工进公司的正当理由通常与员工的个人行为、公司规章制度或法律法规的违反情况相关。以下是一些具体的情况分析：

1. 员工严重违反公司规章制度：

   • 如果员工的行为严重违反了公司制定的规章制度，且这些规章制度是合法、合理并经过公示或告知员工的，公司有权依据规章制度对员工进行相应的纪律处分，包括暂时或永久禁止其进入公司。例如，员工盗窃公司财物、严重违反工作纪律或安全规定等。

2. 员工涉嫌违法犯罪：

   • 如果员工涉嫌违法犯罪，且该行为与公司利益或工作环境安全直接相关，公司有权在法律允许的范围内采取必要措施，包括限制其进入公司，以保护公司和其他员工的合法权益。但这种情况下，公司应尽快与相关部门（如警方）联系，并遵循法律程序处理。

3. 员工健康或安全风险：

   • 如果员工因健康原因（如传染病）或行为（如暴力倾向）可能对公司或其他员工构成安全风险，公司有权在确保员工权益的前提下，采取必要的预防措施，包括暂时禁止其进入公司。但这一措施应基于合理的医疗或安全评估，并遵循相关法律法规。

4. 劳动合同或公司政策明确规定：

   • 如果劳动合同或公司政策中明确规定了某些情况下公司可以禁止员工进入公司（如员工在试用期内不符合录用条件、员工严重失职等），且这些规定不违反法律法规的强制性规定，公司有权依据这些规定采取行动。

在采取禁止员工进入公司的措施时，公司应注意以下几点：

• 合法性：确保所采取的措施符合相关法律法规的规定，不侵犯员工的合法权益。
• 合理性：措施应基于合理的事实和证据，且应与员工的行为或情况相适应。
• 程序正当性：在采取措施前，应尽可能与员工进行沟通，听取其陈述和申辩，并遵循公司内部的纪律处分程序。
• 及时性：一旦发现员工存在应禁止进入公司的情况，应及时采取措施，以避免对公司造成不必要的损失或风险。

若公司无正当理由禁止员工进入公司，可能面临以下法律后果：

• 员工可能提起劳动仲裁或诉讼：要求公司恢复其工作权利、支付工资损失或赔偿其他损失。
• 公司声誉受损：无正当理由禁止员工进入公司可能引发社会舆论关注，对公司声誉造成负面影响。

建议：公司在处理此类情况时，应谨慎行事，确保所采取的措施合法、合理且程序正当。如有任何疑问或需要进一步的法律指导，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。