若总包不配合竣工验收，建设单位可以采取以下措施来应对：
依据合同条款处理：
- 审查合同：首先，建设单位应仔细审查与总包签订的施工合同，特别是关于竣工验收、违约责任等条款。合同中通常会明确规定总包在竣工验收阶段的义务和责任，以及不履行义务时应承担的违约责任。
- 发送书面通知：若总包未按照合同约定配合竣工验收，建设单位可以向总包发送书面通知，要求其立即履行配合义务，并明确指出其违约行为及可能面临的法律后果。
寻求法律途径解决：
- 提起诉讼或仲裁：如果总包在收到书面通知后仍不配合竣工验收，建设单位可以根据合同中的争议解决条款，选择向法院提起诉讼或向仲裁机构申请仲裁，要求总包承担违约责任，并赔偿因此造成的损失。
- 申请先予执行：在诉讼或仲裁过程中，如果情况紧急，建设单位还可以向法院申请先予执行，要求总包立即配合竣工验收，以确保工程能够及时投入使用或进行下一步工作。
利用行政监管手段：
- 向相关部门投诉：建设单位可以向当地的建设行政主管部门或工程质量监督机构投诉总包的不配合行为。这些部门有权对总包进行监管，并可以采取相应的行政措施，如责令整改、罚款等，以促使总包履行配合义务。
考虑其他替代方案：
- 自行组织验收：在总包不配合的情况下，如果建设单位认为工程已经具备竣工验收条件，且自行组织验收不会损害公共利益和他人合法权益，可以考虑自行组织验收。但需注意，自行组织验收应严格按照相关法律法规和规范进行，并确保验收结果的合法性和有效性。
- 委托第三方机构验收：建设单位还可以委托具有相应资质的第三方机构进行竣工验收。第三方机构应独立、客观、公正地进行验收，并出具验收报告。验收报告可以作为工程是否具备交付使用条件的依据。
在处理此类问题时，建设单位还需注意以下法律背景和建议：
- 法律背景：根据《中华人民共和国建筑法》、《中华人民共和国合同法》等相关法律法规的规定，总包有义务按照合同约定配合建设单位进行竣工验收。如果总包不履行该义务，建设单位有权要求其承担违约责任，并可以通过法律途径维护自己的合法权益。
- 建议：在处理此类问题时，建设单位应保持冷静和理性，避免采取过激行为或言语。同时，应积极收集证据，如合同、书面通知、沟通记录等，以证明总包的不配合行为及自己的损失情况。这些证据将在后续的法律程序中发挥重要作用。
若遇到总包不配合竣工验收的情况，建设单位应根据合同条款、法律途径、行政监管手段以及其他替代方案等多方面进行综合考虑和处理。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。