您好，关于“不是备案的公章有没有效”这一问题，这确实是一个涉及法律效力和实际应用的重要问题。
首先，我们需要明确的是，公章的效力并非仅仅取决于其是否备案。备案公章是企业在相关部门进行登记备案，具有官方认可的效力，但这并不意味着非备案公章就完全没有法律效力。在实际操作中，非备案公章的法律效力需要根据具体情况进行认定。
从法律层面来看：
合同效力：如果合同上加盖的是非备案公章，但合同内容真实、合法，且双方当事人均认可该合同，那么该合同仍然可能具有法律效力。然而，如果合同一方对公章的真实性提出质疑，并能够提供证据证明该公章并非企业常用或备案的公章，那么合同的效力就可能受到质疑。
举证责任：在涉及非备案公章的纠纷中，举证责任通常落在提出质疑的一方。即，如果一方认为合同上的公章无效，那么该方需要提供证据证明该公章并非企业所用或备案的公章。
法律后果：如果非备案公章被用于非法活动或欺诈行为，那么使用该公章的个人或企业将可能承担法律责任。
从实际应用层面来看：
企业信誉：使用非备案公章可能损害企业的信誉和形象，因为这可能被视为企业不正规或存在管理漏洞。
业务风险：在商业合作中，如果对方发现企业使用的是非备案公章，可能会对企业的诚信和合作意愿产生质疑，从而增加业务风险。
管理建议：为了避免潜在的法律风险和业务风险，建议企业尽量使用备案公章，并加强公章的管理和使用规范。
具体案例参考：
以您提供的案例为例，赵某持有的借款手续上加盖的公章经鉴定与粮油公司在工商档案中留存的印章不是同一枚印章，且赵某未能提供证据证明粮油公司曾使用过借款手续上加盖的印章。因此，法院无法确定赵某与粮油公司之间存在民间借贷法律关系，并据此驳回了赵某的诉讼请求。这个案例就很好地说明了非备案公章在法律纠纷中的效力问题。
总结建议：
综上所述，不是备案的公章并不一定无效，但其法律效力需要根据具体情况进行认定。为了避免潜在的法律风险和业务风险，建议企业尽量使用备案公章，并加强公章的管理和使用规范。同时，在涉及合同或法律文件时，务必确保公章的真实性和合法性，以维护企业的合法权益和信誉形象。