结论：小产权房合同无效后，实际居住者一般不能主张占有保护，但在特定情形下，可能基于事实管理关系获得一定程度的保护。以下从不同角度进行详细分析：
一、小产权房合同无效的法律基础
小产权房通常指的是在农村集体土地上建设的房屋，未缴纳土地出让金等费用，其产权证不是由国家房管部门颁发，而是由乡政府或村政府颁发，亦称“乡产权房”。根据相关法律法规，小产权房的买卖合同往往因违反法律、行政法规的强制性规定而被认定为无效。合同无效后，自始没有法律约束力，因该合同取得的财产，应当予以返还；不能返还或者没有必要返还的，应当折价补偿。有过错的一方应当赔偿对方因此所受到的损失，双方都有过错的，应当各自承担相应的责任。
二、实际居住者能否主张占有保护
一般原则：
- 在小产权房合同无效的情况下，实际居住者并不能基于合同关系主张对房屋的合法占有。因为合同无效意味着双方之间不存在有效的法律关系，实际居住者的占有行为缺乏法律基础。
特定情形下的保护：
- 事实管理关系：尽管合同无效，但如果实际居住者对房屋进行了实际的维护、管理，并支付了相关费用（如水电费、物业费等），可能构成事实上的管理关系。在这种情况下，实际居住者可能基于公平原则或不当得利原则，要求房屋的原所有人或出卖人给予一定的补偿或赔偿。
- 善意占有：如果实际居住者在购买小产权房时并不知道其违法性，且支付了合理的对价，可能构成善意占有。然而，在我国法律体系中，善意占有主要适用于动产，对于不动产（如房屋）的善意占有，其保护力度相对较弱，且通常需要满足更为严格的条件。
- 实际使用人的权益：在某些特殊情况下，如实际居住者已经长期居住且对房屋进行了大量投入，法院可能会考虑其实际使用人的权益，给予一定程度的保护。但这种保护并非基于占有保护，而是基于公平、正义等法律原则进行的权衡。
三、法律建议
对于购买者：
- 在购买房屋时，应务必核实房屋的产权状况，避免购买小产权房等存在法律风险的房屋。
- 如果已经购买了小产权房且合同被认定为无效，应及时与出卖人协商解决方案，如退房、赔偿等。
- 在协商无果的情况下，可以向法院提起诉讼，要求出卖人承担相应的法律责任。
对于出卖人：
- 应遵守相关法律法规，不得违法出售小产权房。
- 如果已经出售了小产权房且合同被认定为无效，应积极与购买者协商解决方案，避免引发不必要的法律纠纷。
对于实际居住者：
- 在合同无效的情况下，应尽快与房屋的原所有人或出卖人协商退房或赔偿事宜。
- 如果协商无果且认为自己的权益受到侵害，可以向法院提起诉讼或寻求其他法律途径维护自己的权益。但需注意，这种维护并非基于占有保护，而是基于其他法律原则或规定。
有问题可以直接向我咨询，我会结合你的具体情况，给出更详细的法律分析和建议。