关于公司宿舍（包括工厂宿舍）抽烟罚款的合法性，这并非一个简单的是非问题，而是需要依据具体情况进行综合分析。以下是我为您提供的详细解答：
一、罚款合法性的基本判断
首先，我们需要明确的是，罚款作为行政处罚的一种形式，根据《行政处罚法》的规定，通常只有具有行政处罚权的行政机关和法律、法规授权的具有管理公共事务职能的组织才能实施。公司，作为普通的民事主体，并不具备法律直接授予的行政处罚权。因此，在一般情况下，公司直接对员工进行罚款是不合法的。
二、特殊情况下的合法性分析
然而，也存在一些特殊情况，使得公司宿舍抽烟罚款可能具备合法性：
合同约定：如果劳动合同或宿舍使用协议中明确约定了员工在宿舍抽烟属于违约行为，并需承担一定数额的费用作为违约金，且该约定是双方真实意思表示，无欺诈、胁迫等情形，同时违约金的数额合理（即不超过实际损失或合理范围），那么这种罚款（或更准确地说，是违约责任的承担方式）可能被视为合法。
规章制度合法制定并公示：如果公司制定了明确的宿舍管理规定，其中包含了关于抽烟罚款的条款，并且这些规定经过了民主程序制定（如经过职工代表大会或全体职工讨论），与工会或职工代表平等协商确定，且已经向员工进行了公示，告知了具体的罚款规定内容，那么该规定在一定程度上会被认为具有合理性和合法性基础。但即便如此，罚款也必须合理、公正，且不得损害员工的合法权益。
实际损失赔偿：如果员工在宿舍抽烟导致了安全隐患或造成了公司的实际损失（如宿舍设施损坏、引发火灾等），公司可以依据《民法典》等相关法律规定，要求员工承担赔偿责任。这种赔偿是基于侵权或违约行为的法律责任，与罚款性质不同，但可能在形式上表现为要求员工支付一定数额的费用。
三、员工权益保护建议
如果您认为公司宿舍抽烟罚款行为不合法或存在争议，我建议您采取以下措施来维护自己的合法权益：
与公司沟通协商：首先，您可以与公司进行沟通协商，要求其说明罚款的依据和合理性。如果公司能够提供合理的解释和依据，且您认为罚款金额合理，那么可以考虑接受罚款。
向劳动监察部门投诉：如果您认为公司的罚款行为不合法或存在欺诈、胁迫等情形，您可以向当地的劳动监察部门投诉。劳动监察部门将会对公司的行为进行调查，并根据调查结果作出相应的处理。
通过法律途径维护权益：如果协商和投诉均无法解决问题，您还可以考虑通过劳动仲裁或诉讼等法律途径来维护自己的权益。在仲裁或诉讼过程中，您需要提供充分的证据来证明公司的罚款行为不合法或存在争议。
综上所述，公司宿舍抽烟罚款的合法性需根据具体情况来判断。在面对此类问题时，我建议您保持冷静、理性分析，并采取适当的行动来维护自己的合法权益。