结论概述：
股权回购协议中未约定行权时间，若超过6个月，其法律后果主要取决于协议的具体内容、双方当事人的行为以及相关法律法规的规定。一般来说，这可能导致回购权行使的不确定性增加，甚至可能因超过合理期限而丧失回购权，但并非绝对，需结合具体情况分析。
详细分析：
协议内容与双方行为：
- 协议解释：首先，应审查股权回购协议的其他条款，看是否有关于行权时间的隐含规定或可以推断出行权时间的条款。如果协议中有其他相关条款，应依据这些条款来确定行权时间。
- 双方行为：其次，考虑双方当事人在协议签订后的行为。如果一方在超过6个月后仍然表示愿意回购或接受回购，且另一方未提出异议，这可能被视为双方对行权时间的默示变更。
法律法规的规定：
- 合理期限原则：在缺乏具体约定的情况下，法律通常遵循“合理期限”原则。这意味着，回购权的行使应在一个合理的期限内进行，以避免对另一方造成不公平的损害。6个月可能被视为一个参考期限，但并非绝对标准，具体还需根据交易性质、行业惯例、双方关系等因素综合判断。
- 诉讼时效：如果回购权长期未行使，还可能涉及诉讼时效的问题。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年。但这一规定主要适用于因违约或侵权产生的请求权，对于股权回购协议中的回购权，其性质可能更接近于形成权或请求权，具体适用需结合协议内容和法律规定判断。不过，即使超过诉讼时效，也并不意味着回购权完全丧失，而是可能面临对方提出时效抗辩的风险。
可能的风险与后果：
- 回购权丧失：如果超过合理期限且没有法律依据或双方约定支持，回购方可能丧失回购权，无法再要求对方履行回购义务。
- 纠纷与诉讼：双方可能因回购权行使问题产生纠纷，甚至诉诸法律途径解决。这将增加双方的时间、精力和经济成本。
法律建议：
- 明确约定行权时间：为避免未来可能出现的纠纷，建议在股权回购协议中明确约定行权时间，包括起始时间和截止时间。
- 及时行使回购权：如果协议中未约定行权时间，回购方应在合理期限内及时行使回购权，并保留相关证据以证明其行使行为的及时性。
- 协商与补充协议：如果双方对行权时间存在争议或未约定，应及时协商并签订补充协议以明确行权时间。
- 寻求法律帮助：在涉及复杂法律问题时，建议咨询专业律师以获取更具体、更专业的法律建议。
示例说明：
假设甲公司与乙股东签订了一份股权回购协议，但未约定行权时间。6个月后，甲公司决定行使回购权，但乙股东认为已超过合理期限而拒绝。此时，甲公司可以首先审查协议其他条款和双方行为，看是否有可以推断出行权时间的依据；如果没有，则可以参考行业惯例和交易性质来判断6个月是否构成合理期限；如果仍然无法确定，则可以与乙股东协商或寻求法律帮助以解决争议。