在起诉离婚时，若需要调查对方分居期间的银行流水，一般可以查询分居期间至起诉时的银行流水记录，但具体能查几年的流水，需结合实际情况及法院要求来确定，没有固定的年限限制。以下是对此问题的详细分析：

一、银行流水查询的基本原则

在离婚诉讼中，银行流水作为夫妻共同财产分割的重要证据之一，其查询范围通常遵循以下原则：

1. 相关性原则：查询的银行流水应与夫妻共同财产的分割具有直接关联性。即，需要证明某笔或某段时间内的资金流动与夫妻共同财产有关。
2. 合理性原则：查询的银行流水时间范围应合理，通常不会无限制地追溯过去。法院会根据案件的具体情况，如分居时间、财产状况等，来确定查询的合理时间范围。

二、分居期间银行流水查询的具体情况

1. 分居时间较短：如果分居时间较短，比如只有一两年，那么法院可能会要求查询整个分居期间的银行流水，以全面了解夫妻共同财产的变动情况。
2. 分居时间较长：如果分居时间较长，比如五六年，那么法院可能会根据案件的具体情况，如双方的经济状况、财产变动情况等，来确定查询的银行流水时间范围。在这种情况下，法院可能会要求查询分居期间较近几年的银行流水，或者根据当事人的申请和证据情况，适当扩大查询范围。
3. 特殊情况：如果存在一方隐藏、转移、变卖夫妻共同财产等行为，那么法院可能会根据当事人的申请，扩大银行流水的查询范围，以查明财产的真实情况。

三、实际操作中的建议

1. 收集证据：在起诉离婚前，应尽可能收集与夫妻共同财产相关的证据，包括银行流水、房产证明、车辆证明等。这些证据将有助于证明夫妻共同财产的变动情况，为法院判决提供依据。
2. 申请法院调查：如果无法自行获取对方的银行流水记录，可以向法院申请调查令，要求银行提供相关记录。在申请时，应明确说明查询的目的、范围和时间等，以便法院作出合理的决定。
3. 咨询专业律师：由于离婚诉讼涉及复杂的法律问题和证据收集，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。律师可以根据案件的具体情况，为你制定合适的诉讼策略，并帮助你收集、整理和提交相关证据。

四、法律依据

• 《中华人民共和国民法典》第一千零九十二条：夫妻一方隐藏、转移、变卖、毁损、挥霍夫妻共同财产，或者伪造夫妻共同债务企图侵占另一方财产的，在离婚分割夫妻共同财产时，对该方可以少分或者不分。离婚后，另一方发现有上述行为的，可以向人民法院提起诉讼，请求再次分割夫妻共同财产。这一条款虽然未直接涉及银行流水查询的问题，但强调了夫妻共同财产分割的公平性和诚实信用原则，为法院在处理此类案件时提供了法律依据。
• 《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释：规定了当事人申请法院调查取证的程序和要求。在离婚诉讼中，如果当事人无法自行获取相关证据，可以向法院申请调查令或要求法院依职权调查取证。

在处理此类问题时，请务必保持冷静和理性，通过合法途径维护自己的权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。