事业单位在聘用合同到期时，有权选择不续聘，但必须遵循相关法律法规的规定，并保障工作人员的合法权益。以下是对此问题的详细分析：
一、法律法规依据与原则
合同终止与续签自主权：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十四条第一项，劳动合同期满的，劳动合同自然终止。事业单位作为用人单位，享有自主用人权，可以根据岗位需求、人员编制及员工表现等因素决定是否续签聘用合同。
- 同时，《事业单位人事管理条例》也指出，事业单位与工作人员订立的聘用合同期限一般不低于3年，合同到期后单位需依法处理续签事宜。
经济补偿与赔偿金：
- 若事业单位决定不续签聘用合同，且不存在员工拒绝在维持或提高原合同约定条件下续签的情况，根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十六条第五项，事业单位应当向员工支付经济补偿。经济补偿的标准通常按员工在单位的工作年限计算，每满1年支付1个月工资；6个月以上不满1年的，按1年计算；不满6个月的，支付半个月工资的经济补偿。
- 若员工符合签订无固定期限劳动合同条件（如连续工作满十年）且事业单位拒绝续签，则可能视为违法解除劳动合同，事业单位需按法律规定支付赔偿金。
二、到期不续聘的常见情形与程序
常见情形：
- 合同期满考核不合格：事业单位会在合同期满前对工作人员进行考核，未达标者可能面临不续聘。
- 岗位调整或撤销：因职能调整、机构改革导致岗位变动，无合适岗位安排的工作人员可能被不续聘。
- 编制限制：受编制控制影响，无法继续提供岗位的事业单位可能会在合同到期时不续聘部分人员。
程序要求：
- 提前书面通知：事业单位应至少提前30日以书面形式通知工作人员不续聘的决定，明确终止日期及原因。
- 听取意见与申诉：工作人员有权对不续聘决定提出异议，事业单位需认真听取并调查核实，合理意见应予考虑。
- 办理离职手续：合同终止后，工作人员需按要求完成工作交接、财物归还等，事业单位出具离职证明，明确权利义务终止。
三、特殊保护情形下的续签要求
- 员工在本单位连续工作满10年且距法定退休年龄不足10年，提出订立聘用至退休合同的，事业单位必须同意，不得拒绝续签。
- 女职工在孕期、产期、哺乳期等特殊保护期间，事业单位也不得以合同到期为由随意不续签。
四、建议与注意事项
- 提前沟通：事业单位在合同到期前应与员工进行充分沟通，明确不续签的原因和后续安排，以便员工有时间准备新工作机会。
- 合法合规处理：事业单位在做出不续签决定时，应确保决策过程合法合规，避免因违反法律法规而引发纠纷或赔偿责任。
- 经济补偿支付：若决定不续签且需支付经济补偿，事业单位应按照法律规定及时足额支付，以维护员工的合法权益。
总结来说，事业单位在聘用合同到期时选择不续聘是合法的，但必须严格遵守相关法律法规的规定，包括提前通知、支付经济补偿或赔偿金等义务，并特别注意特殊保护情形下的续签要求。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。