网约车挂靠后若因违规运营被抓，公司通常会根据具体情况采取以下处理措施，具体需结合挂靠协议条款、公司管理规定及实际违规情形综合判断：

1. 若因司机个人违规导致车辆被查（如无证运营、超载、拒载等）

   • 公司责任边界：根据《网络预约出租汽车经营服务管理暂行办法》及挂靠协议，若公司已履行对司机的资质审核、培训及日常管理义务（如定期检查车辆证件、提醒合规运营），通常不承担直接行政责任，但需配合交通执法部门调查。
     
   • 对司机的处理：
     
     • 解除挂靠关系：公司可能依据协议条款单方解除合作，要求司机承担违约金或赔偿损失（如车辆扣押期间的停运损失）。
       
     • 追偿损失：若公司因司机违规被罚款或遭受其他损失（如车辆被暂扣产生的拖车费、停车费），可向司机追偿。
       
     • 行业通报：部分平台会将严重违规司机列入黑名单，禁止其再次挂靠或注册。
       

2. 若因公司管理疏漏导致车辆被查（如未审核司机资质、车辆未取得网约车运输证等）

   • 行政责任：公司可能被交通主管部门认定为“提供服务车辆未取得《网络预约出租汽车运输证》”或“线上提供服务车辆与线下实际提供服务车辆不一致”，面临罚款（如《办法》第三十五条规定的1万-3万元罚款）。
     
   • 对司机的处理：
     
     • 协商解决：公司可能与司机协商分担罚款或损失，但需以协议约定为准。
       
     • 终止合作：若公司因违规被吊销经营许可或面临重大处罚，可能直接终止与所有司机的挂靠关系。
       

3. 若因第三方原因导致车辆被查（如交通事故、乘客投诉等）

   • 交通事故：若司机负全责，公司可能要求司机承担保险赔付不足部分；若公司未投保足额保险，可能需承担连带责任。
     
   • 乘客投诉：公司可能根据投诉内容对司机进行警告、扣分或暂停派单，但通常不直接导致挂靠关系解除，除非投诉涉及严重违法（如性骚扰、盗窃）。
     

建议行动：

• 司机：立即联系公司了解被查原因，配合调查并保留证据（如挂靠协议、缴费凭证、沟通记录）；若认为公司存在过错，可依据《民法典》第五百七十七条要求公司承担违约责任。
  
• 公司：应完善挂靠协议条款，明确双方权利义务；加强司机合规培训，定期核查车辆及司机资质；被查后积极配合执法部门，降低行政处罚风险。
  

提示：网约车挂靠关系受《民法典》《道路交通安全法》《网络预约出租汽车经营服务管理暂行办法》等多部法律法规约束，具体处理需结合案件细节及地方性法规。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体场景下的法律风险。