公司强制员工停薪留职通常是不合法的。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据与劳动合同变更
根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十五条，劳动合同的变更必须经用人单位与劳动者协商一致，并采用书面形式。这意味着，未经劳动者同意，用人单位单方面强制停薪留职，构成对劳动合同的非法变更，违反了法律规定。同时，《中华人民共和国劳动法》第五十条也明确指出，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或无故拖欠。强制停薪留职直接剥夺了劳动者依法获得劳动报酬的权利，因此是违法的。
二、停薪留职的合法性前提
停薪留职应基于员工个人申请，并经过企业批准。没有员工的主动参与和同意，企业不能单方面强制实施停薪留职。即使员工提出停薪留职申请，企业也应与员工签订书面协议，明确双方的权利和义务，确保员工的合法权益得到保障。在缺乏员工同意或书面协议的情况下，企业强制停薪留职是不合法的。
三、特殊情况的法律分析
法定医疗期：企业职工因患病或非因工负伤需要停止工作医疗时，享有3个月到24个月的医疗期。在此期间，用人单位不能强制停薪留职，而应按规定支付病假工资或疾病救济费。
劳动者过错处理：如果劳动者严重违反用人单位规章制度或给用人单位造成重大损害，用人单位可以依据《劳动合同法》第三十九条解除劳动合同。但在解除前，不能擅自强制停薪留职，而应按法定程序处理。
四、企业强制停薪留职的法律责任
如果企业违反法律规定强行让员工停薪留职，可能面临严重的法律责任。劳动行政部门可以责令企业限期支付劳动报酬，并可要求企业按应付金额的一定比例向劳动者加付赔偿金。若因此导致劳动合同解除或终止，企业还可能需要支付经济补偿金，进一步增加其违法成本。
五、员工权益的保障与建议
协商解决：员工在遇到企业强制停薪留职的情况时，应首先与企业进行协商，寻求合理解决方案。在协商过程中，员工可以明确表达自己的权益和诉求，要求企业遵守相关法律法规。
投诉举报：如果协商无果，员工可以向当地劳动行政部门投诉举报。劳动行政部门将会对企业的违法行为进行调查处理，并维护员工的合法权益。
申请劳动仲裁或提起诉讼：在必要时，员工可以申请劳动仲裁或提起诉讼来维护自己的合法权益。劳动仲裁机构或法院将会对双方的争议进行公正裁决，并保障员工的合法权益得到实现。
总结来说，公司强制员工停薪留职通常是不合法的。企业应严格遵守相关法律法规，尊重员工的合法权益；员工也应积极了解自己的权利并学会运用法律武器来维护自身权益。如果您在劳动纠纷方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。