在办理非法经营刑事案件的受案初查阶段，若发现手机可能作为犯罪工具或存储有与犯罪相关的证据，公安机关可以依法对手机采取扣押、查封、技术侦查等措施，具体如下：

1. 扣押手机：

   • 法律依据：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百四十一条的规定，在侦查活动中发现的可用以证明犯罪嫌疑人有罪或者无罪的各种财物、文件，应当查封、扣押；与案件无关的财物、文件，不得查封、扣押。
   • 实施条件：若手机被怀疑为犯罪工具或存储有与非法经营犯罪相关的证据，如交易记录、通讯记录等，公安机关有权依法扣押。
   • 程序要求：扣押手机时，应当会同在场见证人和被扣押物品持有人查点清楚，当场开列清单一式二份，由侦查人员、见证人和持有人签名或者盖章，一份交给持有人，另一份附卷备查。

2. 查封手机（如涉及存储设备或云服务）：

   • 适用场景：若手机中的数据存储在云端或外部存储设备中，且这些数据与非法经营犯罪有关，公安机关可能会对相关存储设备或云服务进行查封。
   • 实施方式：查封通常涉及对存储设备的物理封存或对云服务的访问限制，以确保数据不被篡改或删除。

3. 技术侦查措施（如适用）：

   • 特殊情形：在特定情况下，如犯罪嫌疑人的手机通讯可能涉及更广泛的犯罪网络或需要实时监控，公安机关可能会依法采取技术侦查措施，如监听、监控等。
   • 严格审批：技术侦查措施的实施需要经过严格的审批程序，并确保符合法律规定的条件和范围。

注意事项：

• 合法性：所有对手机的措施都必须依法进行，确保程序的合法性和正当性。
• 证据保护：在扣押、查封或采取技术侦查措施时，应确保手机及其存储的数据不被损坏或丢失，以维护证据的完整性和有效性。
• 权利保障：犯罪嫌疑人的合法权益应得到保障，如有权对扣押、查封等措施提出异议或申请复议。

在办理此类案件时，建议与公安机关密切沟通，确保所有措施都符合法律规定，并充分保护犯罪嫌疑人的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律指导，请随时向我咨询。