结论前置：合同没有纸质文件，双方盖章扫描后，在一定条件下是具有法律效力的，但相较于原件，其证明力较弱且存在诸多风险。以下从多个角度为您详细分析：
一、法律效力分析
电子合同的合法性：
- 根据《中华人民共和国民法典》第四百六十九条，当事人订立合同可以采用书面形式、口头形式或者其他形式。书面形式包括合同书、信件以及数据电文（如电报、电传、传真、电子数据交换和电子邮件）等可以有形地表现所载内容的形式。因此，扫描件作为电子数据的一种表现形式，只要能够清晰地展示合同的内容，并经过双方当事人的确认，就可以视为有效的书面合同。
真实意思表示与签字盖章：
- 合同的有效性取决于双方当事人的真实意思表示，并且需要签字或盖章来确认。在电子合同中，虽然无法直接进行手写签名或盖章，但可以通过电子签名技术来实现等效的法律效果。如果双方在扫描件上进行了电子签名或使用了其他可靠的电子认证方式，且能够证明签名的真实性和有效性，那么该扫描件就具有与纸质合同同等的法律效力。
证据效力：
- 在发生纠纷时，扫描件可以作为证据使用。然而，其证据效力可能受到质疑，因为扫描件容易被篡改或伪造。为了增强扫描件的证据效力，建议采取以下措施：
- 确保扫描过程清晰、完整，无遗漏或模糊之处；
- 使用可靠的电子签名技术或其他电子认证方式来确认签名的真实性和有效性；
- 在必要时，可以寻求第三方机构对扫描件进行鉴定或公证。
二、存在的风险及注意事项
证明原件难度：
- 扫描件作为复制件，若无法提供原件核对，根据《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》，其不能单独作为认定案件事实的根据。这意味着扫描件的证明力相对较弱，可能无法得到法院的完全认可。
易被篡改：
- 扫描件易于通过技术手段修改，不像纸质原件那样容易辨别真伪。一旦扫描件被篡改，将给合同的真实性和有效性认定带来极大困难。
法律建议：
- 为了避免潜在的法律风险，确保合同的顺利履行和自身合法权益，建议在签订重要合同时，尽量采用当面签订纸质合同并留存原件的方式。
- 如果因特殊情况只能先以扫描件形式签订，后续也应当及时补签纸质合同，并确保双方对扫描件的内容无异议。
- 在合同执行过程中，应妥善保管好合同原件，防止丢失或损毁。
三、实际操作建议
选择合适的传输方式：
- 为了确保扫描件的安全传输，应选择安全可靠的通信渠道，如加密邮件或安全的文件传输协议。避免通过不安全的网络或公共设备传输敏感信息。
保留相关证据：
- 在发送扫描件后，应妥善保存好相关的传输记录、确认回执等证据材料。这些证据在后续可能出现的争议中具有重要的证明作用。
总结：虽然合同没有纸质文件，双方盖章扫描后在一定程度上具有法律效力，但由于其存在的风险和证明力的限制，建议在实际操作中尽量使用并保存合同原件。如有任何疑问或需要进一步了解相关法律法规，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。