法院收到被告证据后，会依法进行审查、组织质证，并根据情况决定是否采纳。具体处理流程如下：

1. 接收与登记
   法院在收到被告提交的证据材料后，会首先进行形式审查，确认证据是否符合法定形式要求（如证据清单、原件/复印件等），并登记在案。若证据存在瑕疵（如未盖章、未签名），法院会要求被告限期补正。

2. 送达与通知
   法院会将被告提交的证据副本送达原告及其他诉讼参与人，并通知各方在指定期限内提出书面质证意见或申请延期质证。此步骤确保原告的知情权与抗辩权。

3. 庭审质证
   在开庭审理阶段，法院会组织双方对证据进行质证。被告需说明证据的来源、内容及证明目的，原告可对证据的真实性、合法性、关联性提出异议（如质疑证据系伪造、非法取得或与案件无关）。法院会记录质证过程，作为裁判依据。

4. 证据审查与认定
   法院会根据《民事诉讼法》及相关司法解释，对证据进行实质审查：

   • 真实性：证据是否为原件、是否存在篡改痕迹；
     
   • 合法性：证据取得方式是否合法（如禁止通过窃听、胁迫获取证据）；
     
   • 关联性：证据是否与案件事实存在逻辑联系。
     若证据符合“三性”要求，法院会予以采纳；否则，可能排除该证据或要求被告补充其他证据。

5. 特殊情形处理

   • 逾期提交证据：若被告未在举证期限内提交证据，法院可能不予采纳，但对方同意质证或证据涉及国家利益、社会公共利益等除外；
     
   • 证据保全：若证据可能灭失或以后难以取得，法院可依申请或依职权采取保全措施；
     
   • 专家辅助人：对专业性较强的证据（如医疗鉴定、财务审计），法院可通知专家出庭协助质证。

提示：证据是诉讼的核心，被告应严格遵守举证期限，确保证据的合法性与关联性。若对证据提交或质证流程有疑问，可直接向我咨询具体案件操作。