在行政复议答复中，证据目录通常是需要包含主体证明的。以下从几个方面进行详细分析：

一、主体证明的重要性

在行政复议过程中，主体证明是确认申请人、被申请人以及第三人身份和资格的关键证据。它有助于复议机关准确识别各方当事人，确保复议程序的合法性和公正性。如果证据目录中缺少主体证明，可能会导致复议机关对当事人身份产生疑问，进而影响复议程序的顺利进行。

二、主体证明的具体内容

主体证明通常包括但不限于以下内容：

1. 申请人身份证明：如身份证、营业执照等，用于证明申请人的身份和资格。
2. 被申请人身份证明：如行政机关的法人证书、组织机构代码证等，用于证明被申请人的身份和行政主体资格。
3. 第三人身份证明（如有）：如果复议案件涉及第三人，也需要提供第三人的身份证明。

三、证据目录的编制要求

在编制行政复议答复的证据目录时，除了主体证明外，还应包括其他与案件相关的证据材料。证据目录应清晰、准确地列出每份证据的名称、来源、证明对象以及页码等信息，以便复议机关能够迅速、准确地了解证据情况。同时，证据目录应按照一定的逻辑顺序进行排列，如按照时间顺序、重要性顺序等，以提高证据的可读性和说服力。

四、实际操作中的注意事项

1. 确保证据的真实性和合法性：在提供主体证明和其他证据材料时，应确保其真实、合法、有效。任何虚假或违法的证据都可能导致复议申请被驳回或承担法律责任。
2. 及时补充和完善证据：如果在复议过程中发现证据不足或需要补充新的证据，应及时向复议机关提出申请并补充相关证据。
3. 遵循复议机关的指导：在编制证据目录和提供证据材料时，应遵循复议机关的指导和要求，确保复议程序的顺利进行。

建议：在准备行政复议答复时，务必重视主体证明的提供，并确保其他证据材料的真实性和合法性。如果对证据目录的编制或行政复议程序有任何疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。