要证明您爸爸与死者儿子的关系，这实际上是一个涉及亲属关系证明的问题，通常可以通过以下几种途径来获取相关证明材料：
一、基础户籍证明材料
户口本：
- 如果您爸爸与死者儿子在同一户口本上，且户口本上明确记载了他们之间的父子（或父与子，考虑到死者儿子可能是您爸爸的直系后代，这里表述为父子关系以涵盖所有可能性，实际根据具体情况调整）关系，那么户口本就是最直接、最常用的证明材料。
户籍登记原始档案：
- 若户口本无法直接反映这一关系，或者户口本已经丢失，您可以向户籍所在地的公安机关申请查询并出具户籍登记原始档案复印件。这份复印件在加盖公安机关公章后，具有较高的证明效力。
二、出生及亲属关系证明
出生证明：
- 如果死者儿子是您爸爸的直系后代（如儿子或孙子），那么死者儿子的出生证明上会明确记载其父母信息。如果出生证明上记载的父母之一是您爸爸，那么这份出生证明就是直接证明他们关系的权威文件。
- 若出生证明丢失，可向出生医院申请补办或查阅档案以获取相关信息。
亲属关系公证书：
- 您可以向当地公证机构申请办理亲属关系公证。公证机构会严格审核您提供的材料，如户口本、出生证明等，并出具具有较高法律效力的亲属关系公证书。这份公证书将明确记载您爸爸与死者儿子之间的亲属关系。
三、其他辅助证明材料
人事档案证明：
- 如果您爸爸或死者儿子（或其父母，如果死者儿子是您爸爸的孙子）所在单位的人事档案中记载有家庭成员关系，您可以向原工作单位人事部门提出申请，查阅并复印相关档案材料。这些材料在由人事部门盖章确认后，也可以作为证明亲属关系的辅助材料。
村委会或居委会证明：
- 如果您爸爸与死者儿子长期在农村或城市社区生活，且关系为当地居民所熟知，您可以向所在村委会或居委会申请出具证明材料。这份证明材料在加盖村委会或居委会公章后，虽然证明效力相对较弱，但在某些情况下也能提供一定的支持。
证人证言：
- 了解您爸爸与死者儿子关系的亲属、邻居、朋友等可以作为证人，出具证人证言。然而，证人证言的证明效力相对较弱，通常需要与其他证明材料相互印证才能形成完整的证据链。
四、特殊情况下的证明方式
- 亲子鉴定：
- 在极少数情况下，如果其他证明方式都无法满足需求，或者存在争议，您可以通过亲子鉴定来证明您爸爸与死者儿子之间的生物学关系。亲子鉴定报告是通过遗传标记检测来判断生物学亲子关系的，具有准确且权威的特点。
注意事项
- 在准备这些证明材料时，请确保所有材料的真实性、合法性和有效性。
- 如果您打算将这些证明材料用于法律操作或申请，建议先咨询专业律师，以确保材料的合规性和有效性。
- 在实际操作中，应综合考虑各种途径，优先选择便捷、高效且法律效力强的方式。当一种方式无法满足需求时，可尝试结合多种方式，形成完整的证据链。
综上所述，通过综合运用户口本、出生证明、亲属关系公证书、人事档案证明、村委会或居委会证明以及证人证言等多种方式，并结合特殊情况下的亲子鉴定，您可以有效证明您爸爸与死者儿子之间的关系。