针对您提出的“员工做了4天，扣员工办健康证费用是否合理”的问题，我们需要从多个角度来分析这一行为的合法性及合理性。
首先，从法律层面来看，用人单位直接扣除员工工资用于支付健康证费用，通常是不被允许的，除非这种扣除有明确的法律依据或劳动合同中的明确约定。根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，工资是劳动者提供劳动后应得的报酬，用人单位不得无故克扣或拖欠。健康证费用，若属于员工入职前必须自行承担的费用（如某些特定行业要求员工自行办理健康证作为入职条件），则通常应由员工个人承担，但不应从已提供的劳动报酬中直接扣除。
其次，我们考虑劳动合同及公司规章制度。如果劳动合同或公司规章制度中明确规定了健康证费用的承担方式，并且这一规定不违反法律法规的强制性规定，那么按照合同或制度执行是合理的。但关键在于，这种规定必须事先明确告知员工，并经过员工的同意（如通过签订劳动合同或确认知晓规章制度的方式）。若公司未事先告知或未经员工同意，单方面从工资中扣除健康证费用，则可能构成违法克扣工资。
再者，从公平合理原则出发，即使健康证费用需要由员工承担，公司也应采取合理的方式通知员工并协商支付方式，而不是直接从已提供的几天劳动报酬中扣除。特别是当员工仅工作了几天，其应得工资可能远低于健康证费用时，这种扣除方式显然对员工不公平。
建议：
核查劳动合同及公司规章制度：首先确认劳动合同或公司规章制度中是否有关于健康证费用承担的规定，以及这些规定是否合法、合理且已事先告知员工。
与公司沟通：如果认为扣除行为不合理，建议与公司人力资源部门或相关负责人进行沟通，表达自己的诉求和理由，寻求合理的解决方案。
寻求法律援助：如果沟通无果，且认为公司行为确实违法，可以向当地劳动行政部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
综上所述，除非有明确的法律依据或劳动合同中的明确约定，并且这种约定不违反法律法规的强制性规定且已事先告知员工，否则公司直接从员工仅工作几天的工资中扣除健康证费用是不合理的。